RESUMEN 4.1. ESTRUCTURA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS
1.- ¿Qué contiene el ácido desoxirribonucleico (ADN)? (Material genético). Contiene información para especificar las secuencias de aminonoácidos de las proteínas, la que se transcribe a varios tipos de ácidos ribonucleicos (RNA), incluidos el RNA mensajero (mRNA), el RNA de trasferencia (tRNA) y el RNA ribosómico (rRNA), que intervienen en la síntesis de proteínas.
2.- ¿Qué son el DNA y el RNA? Son largos polímeros no ramificados de nucleótidos, que constan de una pentosa fosforilada unida a una base orgánica, ya sea una purina o una pirimidina.
3.- ¿Qué encontramos presente tanto en el DNA como en el RNA? Encontramos las purinas adenina (A) y guanina (G) y la pirimidina citosina (C).
4.- La pirimidina timina (T) que encontramos presente en el DNA, ¿por quién es reemplazada en el RNA? La pirimidina timina (T) presente en el DNA es reemplazada por la pirimidina uracilo (U) en el RNA.
5.- ¿Por qué enlaces se encuentran unidos los nucleótidos adyacentes en un polinucleótido? Están unidos por enlaces fosfodiéster. f osfodiéster.
6.- ¿Qué contiene el DNA natural (DNA B)? Contiene 2 hebras complementarias antiparalelas de polinucleótidos enrolladas entre sí para formar una doble hélice regular con giro hacia la derecha con las bases en la parte interior y los dos esqueletos azúcarfosfato en la parte exterior.
7.- ¿Qué hace que se estabilice la estructura nativa?
El apareamiento de bases entre las hebras y las interacciones hidrófobas entre bases adyacentes en la misma hebra, estabilizan la estructura nativa.
8.- ¿A través de qué pueden interactuar las bases en los ácidos nucleicos? Pueden actuar a través de los enlaces de hidrógeno.
9.- ¿Cuáles son los pares de bases de Watson y Crick estándares en el DNA y RNA? Los pares de bases de Watson y Crick estándares son G.C, A.T en el DNA y A.U en el RNA. (ver página 108).
10.- ¿Qué estructuras estabiliza en apareamiento de bases? Estabiliza las estructuras tridimensionales nativas de DNA y RNA.
11.- ¿Qué puede deformar la unión de proteínas al DNA? La unión de proteínas al DNA puede deformar su estructura helicoidal, provocando la torsión o el desenrollamiento local de la molécula de DNA.
12.- ¿Qué efectos causa el calor en las hebras de DNA? El calor hace que las hebras de DNA se separen o desnaturalicen.
13.- Con qué se incrementa la temperatura de fusión T m del DNA? La temperatura de fusión T m del DNA se incrementa con el porcentaje de pares de bases G.C. En condiciones apropiadas, las hebras separadas de ácidos nucleicos complementarias se renaturalizan.
14.- ¿Cómo pueden estar las moléculas circulares de DNA? Pueden estar enrolladas sobre sí mismas formando superenrollamientos.
15.- ¿Qué función tienen las enzimas topoisomerasas I y II? Pueden aliviar la tensión torsional y eliminar los superenrollamientos de las moléculas circulares de DNA.
16.- ¿Qué son los RNA celulares? Son polinucleótidos monocatenarios, algunos de los cuales forman estructuras secundarias y terciarias bien definidas.
17.- ¿Qué poseen algunos RNA llamados ribozimas? Poseen actividad catalítica.
RESUMEN 4.2.
TRASCRIPCIÓN DE GENES CODIFICADORES DE PROTEÍNAS Y FORMACION DE mRNA FUNCIONAL
1.- ¿Por quién es llevada a cabo la transcripción de DNA? Es llevada a cabo por la RNA polimerasa, que agrega un ribonucleótido por vez al extremo 3’ de la cadena de RNA en crecimiento. La secuencia de la hebra molde de DNA determina el orden en el cual los ribonucleótidos se polimerizan para formar una cadena de RNA.
2.- ¿Qué determina la secuencia de la hebra molde de DNA? Determina el orden en el cual los ribonucleótidos se polimerizan para formar una cadena de RNA.
3.- ¿Cuál es la función de la RNA polimerasa durante la iniciación de la transcripción? Durante la iniciación de la transcripción, la RNA polimerasa se une a sitios específicos en el DNA (el promotor), disocia localmente el DNA de hebra doble para poner al descubierto la hebra molde desapareada y polimeriza los primeros dos nucleótidos.
4.- ¿Qué sucede con la RNA polimerasa durante la elongación (estiramiento) de la hebra? Durante la elongación de la hebra, la RNA polimerasa se desplaza a lo largo del DNA, disociando segmentos secuenciales del DNA y agregando nucleótidos a la hebra de RNA creciente.
5.- ¿Qué sucede cuando la RNA polimerasa llega a una secuencia de terminación en el DNA?
Cuando la RNA polimerasa llega a una secuencia de terminación en el DNA, la enzima detiene la transcripción lo que da como resultado la liberación del RNA terminado y la disociación de la enzima del DNA molde.
6.- ¿Para qué se agrupan los genes codificadores de proteínas en el DNA procarionte? En el DNA procarionte, varios genes codificadores de proteínas suelen agruparse para formar una región funcional, un operón que se transcribe a partir de un único promotor para formar mRNA, que codifica múltiples proteínas con funciones relacionadas.
7.- ¿Cuándo puede comenzar la traducción del mRNA bacteriano? Puede comenzar antes de que la síntesis del mRNA haya sido completada.
8.- ¿Cuál es la función de cada gen codificador de proteínas en el DNA eucarionte? En el DNA eucarionte cada gen codificador de proteínas se transcribe desde su propio promotor. El transcripto primario inicial muy a menudo contiene regiones no codificantes (intrones) diseminadas entre las regiones codificantes (exones).
9.- ¿Qué significa intrones? Intrones significa que no se expresa.
10.- ¿Qué significa exones? Exones significa que se expresa.
11.- ¿Qué atraviesan los transcriptos primarios de eucarionte? Deben atravesar el procesamiento de RNA para producir RNA funcionales. Durante el procesamiento, los extremos de casi todos los transcriptos primarios de los genes codificadores de proteínas se modifican mediante la adición de un casquete 5’ y una cola poli(A) 3’. Los transcriptos de los genes que contienen intrones sufren la escisión (ruptura) y eliminación de intrones y la unión de exones.
12.- ¿Por quiénes son codificados los dominios individuales de las proteínas multidominio presentes en los eucariontes superiores?
A menudo son codificados por exones individuales o por un pequeño número de exones. Las distintas isoformas de tales proteínas suelen expresarse en tipos celulares específicos como resultado del corte y empalme alternativo de exones.
RESUMEN 4.3. CONTROL DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN LOS PROCARIONTES.
1.- ¿Por quién es regulada la expresión génica tanto en los procariontes como en los eucariontes? Es regulada principalmente por mecanismos que controlan la iniciación de la transcripción.
2.- ¿Cuál es el primer paso en la iniciación de la transcripción en E. coli. El primer paso es la unión de la subunidad ó en una RNA polimerasa a una región promotora.
3.- ¿Qué determina la secuencia de nucleótidos de un promotor? La secuencia de nucleótidos de un promotor determina su fuerza, es decir, cuán frecuentemente distintas moléculas de RNA polimerasa se pueden unir e iniciar la transcripción por minuto.
4.- ¿Qué son los represores? Son proteínas que se unen a secuencias operadas, que superponen o se ubican adyacentes a los promotores.
5.- ¿Qué inhibe la unión de un represor a un operador? Inhibe la iniciación de la transcripción.
6.- ¿Por quién es modulada la actividad de unión al DNA de la mayoría de los represores bacterianos? La actividad de unión al DNA de la mayoría de los represores bacterianos es modulada por pequeñas moléculas efectoras (inductoras). Esto le
permite a las células bacterianas regulas la transcripción de genes específicos en respuesta a cambios en la concentración de diversos nutrientes en el medio.
7.- ¿Por quién están regulados el operón lac y algunos otros genes bacterianos? Están regulados por proteínas activadoras que se unen a los promotores contiguos e incrementan la frecuencia de iniciación de la transcripción por la RNA polimerasa.
8.- ¿Cuál es el principal factor sigma en E. coli? Es el (ver pág. 118), pero también se encuentran varios otros factores sigma menos abundantes, cada uno de los cuales reconocen diferentes secuencias promotoras consenso
9.- ¿Por quién son reguladas la iniciación de la transcripción por todas las RNA polimerasas de E. coli? La iniciación de la transcripción por todas las RNA polimerasas de E coli, a excepción de las que contienen (ver pág.118), pueden ser regulada por represores y activadores que se unen cerca del sitio de inicio de la transcripción.
10.- ¿Por quién son regulados los genes transcriptos por RNA polimerasas con (ver pág. 119)? Son regulados por activadores que se unen a los amplificadores ubicados a = 100 pares de base corriente arriba desde el sitio de inicio. Cuando el activador y la RNA polimerasa (ver pág.119) interactúan, el DNA entre sus sitios de unión forma un bucle (rizo).
11.- ¿Qué actúa en los sistemas reguladores de dos componentes? En los sistemas reguladores de dos componentes, una proteína actúa como un sensor, motorizando el nivel de nutrientes u otros componentes en el ambiente. En condiciones apropiadas, el fosfato (ver pág. 119) de un ATP es transferido primero a una histidina en la proteína sensora y luego a un ácido aspártico en la segunda proteína, el regulador de respuesta.
12.- ¿A qué se une el regulador de respuesta fosforilado?
Se une luego a las secuencias reguladoras del DNA, estimulando o reprimiendo de este modo la transcripción de genes específicos.
RESUMEN 4.4.
LAS TRES FUNCIONES DEL RNA EN LA TRADUCCIÓN
1.- ¿Bajo qué forma la información genética es transcripta del DNA al mRNA? Bajo la forma de un código de tripletes degenerados, superpuesto y sin comas.
2.- ¿Por qué está codificado cada aminoácido en el mRNA? Cada aminoácido está codificado trinucleótido (codones) en el mRNA.
por
una
o
más
secuencias
de
3.- ¿Qué especifica cada codón? Cada codón especifica un aminoácido, pero la mayoría de los aminoácidos están codificados por múltiples codones.
4.- ¿Cuál es el codón de inicio más común y qué especifica? El codón AUG para la metionina es el codón de inicio más común y especifica el aminoácido del extremo NH2-terminal de una cadena de proteína.
5.- ¿Cuáles son los codones que funcionan como codones de terminación? Tres codones (UAA,UAG,UGA) funcionan como codones de terminación y no especifican ningún aminoácido.
6.- (Leer punto 4 pág.125) 7.- ¿De qué depende la decodificación de la secuencia de nucleótidos en el mRNA en una secuencia de aminoácidos de una proteína?
La decodificación de la secuencia de nucleótidos en el mRNA en una secuencia de aminoácidos de una proteína depende de los tRNA y de las aminoacil-tRNA sintetasas.
8.- ¿Cómo es la estructura de todos los tRNA? Todos los tRNA tienen una estructura tridimensional similar, que incluye un brazo aceptor para la fijación de un aminoácido específico y un tallo con bucle con una secuencia anticodón de tres bases en el extremo. El anticodón puede aparearse con su correspondiente codón del mRNA.
9.- ¿Con quién puede aparearse un tRNA? Debido a las interacciones no estándares, un tRNA puede aparearse con más de un codón del mRNA; a la inversa, un codón particular puede tener un apareamiento de bases con múltilples tRNA. Sin embargo, en cada caso, sólo el aminoácido adecuado es insertado en una cadena polipeptídica creciente.
10.- ¿Qué reconoce cada una de las 20 aminoacil-tRNA sintetasas? Cada una de las 20 aminoacil-tRNA sintetasas reconoce un único aminoácidos y lo une, mediante enlaces covalentes, a un tRNA análogo, para formar un aminoacil-tRNA. Esta reacción activa el aminoácido para que pueda participar en la formación de un enlace peptídico.
11.- ¿De cuántas subunidades constan tanto los ribosomas de los procariontes como los de los eucariontes? Constan de una subunidad mayor y una menor. Cada subunidad contiene numerosas proteínas diferentes y una molécula principal de rRNA (grande o pequeña). La subunidad grande también contiene un rRNA 5S accesorio en los procariontes y dos rRNA accesorios en los eucariontes (5S y5,8S en los vertebrados).
12.- ¿Para qué se pliegan los rRNA análogos de muchas especies diferentes? Se pliegan para formar estructuras tridimensionales que contienen numerosos tallos con bucles y sitios de unión para proteínas, mRNA y tRNA.
13.- ¿Con qué se asocian muchas proteínas ribosómicas pequeñas?
Se asocian con la periferia de los rRNA.
