Isolasi DNA pada Buah Jeruk, Semangka dan Melon
LAPORAN PRAKTIKM
UNTUK MEMENUHI TUGAS MATA KULIAH Genetika 1 yang dibimbing oleh Prof !r !r H" Siti #$baidah% MPd dan Andik &i"ayanto% SSi% MSi
'leh( Kelom)ok 11 'ffering * I+bal ,ilgrami ,
-1./012/22324
N$r$l Ma5rifah
-1./012/122/4
The Learning University
NI!"RSITAS NI!"RSITAS N"#"RI MALAN# $AKLT $AKLTAS MAT"MATIKA MAT"MATIKA DAN ILM P"N#"TA%AN P"N#" TA%AN ALAM JRSAN BIOLO#I Mare& '()*
A+ JDL I6ola6i !NA )ada ,$ah 7er$k% Semangka dan Melon B+ Tuuan 1 Unt$k Unt$k mengetah$i mengetah$i )engar$ )engar$h h "eni6 "eni6 deter"en deter"en terhada) terhada) ha6il ha6il i6ola6i i6ola6i !NA
b$ah 7er$k% Semangka% dan Melon 8 Unt$k mengetah mengetah$i $i metode metode yang te)at te)at dalam dalam mengi6ol mengi6ola6i a6i !NA !NA b$ah 7er$k% 7er$k% Semangka% dan Melon -+ Rumu Rumusa san n Masal Masalah ah 1 ,agai ,agaima mana na )enga )engar$ r$h h "eni "eni66 deter deter"en "en terh terhad ada) a) ha6i ha6ill i6ol i6ola6 a6ii !NA !NA b$ah b$ah 7er$k% Semangka% dan Melon 8 ,agaim ,agaimana ana 9ara mengeta mengetah$i h$i metode metode yang te)at te)at $nt$k mengi6 mengi6ola ola6i 6i !NA b$ah 7er$k% Semangka% dan Melon D+ Dasa Dasarr Te Teori ori !NA -!eo:yribo -!eo:yribo6e 6e N$9lei9 N$9lei9 A9id4 mer$)aka mer$)akan n 6alah 6alah 6at$ molek$l molek$l a6am n$kleat ber$ntai helik6 ganda yang monomer )olin$kleotidanya beri6i g$la g$g$6 )ento6a% )o6)at% dan ba6a nitrogen -adenine% g$anine% timin% 6ito6in4% mam)$ bere)lika6i dan bertindak 6ebagai materi genetik yang mam)$ di;ari6kan )ada ket$r$ ket$r$na nanny nnyaa -Le;in -Le;in%% 8//<4 8//<4Pa Pada6 da6 6el e$kari e$karioti otik% k% !NA da)at da)at berada berada dalam dalam kloro kloro)la )la6% 6% mito mitokon kondri dria% a% ma$)$ ma$)$n n kromo6 kromo6om om -=ee9e -=ee9e et al. al.% 8/1/ 8/1/4 4 I6ol I6ola6 a6ii !NA !NA mer$)aka mer$)akanlan nlangkah gkah a;al yang har$6 har$6 diker"aka diker"akan n dalamrek dalamrekaya6a aya6a genetika genetika 6ebel$m 6ebel$m melangkah ke)ro6e6 6elan"$tnya 6elan"$tnya Prin6i) da6ar i6ola6i total !NA dari "aringan adalah denga denganme nmeme me9ah 9ah dan menge mengek6t k6trak rak6i 6i "arin "aringan ganter ter6eb 6eb$t $t 6ehin 6ehingga gga akan akan terben terbent$k t$k ek6trak6el yang terdiri ata6 6el>6el "aringan% !NA%dan =NA Kem$dian ek6trak 6el di)$rifika6i6ehingga di)$rifika6i6ehingga diha6ilkan )elet 6el yang mengand$ng !NA total -?aatih% 8//@4 I6ola6i bert$"$an $nt$k mem$rnikan !NA le;at )erlak$an fi6ik ma$)$n )erlak$an kimia Perlak$an fi6ik yang 6ering dig$nakan adalah 6entrif$ga6i dan )enyaringan% 6edan 6edangka gkan n )erlak )erlak$an $an kimia kimia ber$)a ber$)a )ember )emberian ian enim enim hidrol hidroliti itik k terten tertent$ t$ yang yang menghan9$rkan molek$l 6elain !NA -)rotein% =NA% d6b4 -B$lianti% 8//24Hal yang )erl$ di)erhatikan di)erhatikan dalam i6ola6i b$ah adalah tingginya tingginya kand$ngan 6enya;a kontaminan 6e)erti )oli6akarida dan )olifenol -Lodhi et al % % 1@@4
Men$r$t Men$r$t ?aatih -8//@4% Isolasi DNA memiliki beberapatahapan,
yait aitu:
(1) (1)Isol Isolas asii
sel sel;
(2) (2)Lisi Lisis s
dind dindiingda ngdan n
membr embran an
sel sel;
()! ()!ks kstr trak aksi si
dala dalaml mlar arut utan an;;
(")# (")#ur uri$ i$ka kasi si;;
dan dan
(%)# (%)#rresip esipit itas asi& i&
'edangkan menurut oyer (212) terdapat tahap: (1) Perlak$an yang bert$"$an bert$"$an $nt$k $nt$k menghan menghan9$rk 9$rkan an dinding dinding 6el% dengan dengan enim enim 6e)erti 6e)erti li6oim li6oim mengkatali6i6 hidroli6i6 ikatan gliko6idik di dinding 6el% 6ehingga dinding 6el r$6ak dan mem$ngkinkan)ele)a6an !NA dan kom)onen 6el$ler lainnya dari membrane 6el Media $nt$k 6ol$6i dari !NA adalah lar$tan garam b$ffer mengand$ng E!TA !NA% yang ionik% lebih lar$t dan 6tabil dalam lar$tan garam dari dalam air 6$ling -84 !i6o6ia6i protein-DNAcompl protein-DNAcomplexes, exes,$nt$ $nt$k k melar$tk melar$tkan an membran membran 6el dan menggang menggangg$ g$ interak6 interak6ii ionik ionik antara antara hi6ton hi6ton berm$ata berm$atan n )o6itif )o6itif dan t$lang t$lang )$ngg$ng )$ngg$ng berm$atan berm$atan negatif dari !NA Sodi$m dode9yl 6$lfat -S!S4 di)erl$kan $nt$k mengikat )rotein dan memberi karakter anionik yang l$a6 Serta mer$bah 6ifat deo:yribon$9lea6e6 deo:yribon$9lea6e6 dan )rotein lainnya Unt$k mema6tikan mema6tikan di6o6ia6i lengka) kom)lek6 !NA>)rotein dan menghilangkan amina kation terikat% kon6entra6i tinggi garam -Na*l ata$ natri$m )erklorat4 ditambahkan ditambahkan Garam bertindak dengan meng$rangi interak6i ionik antara !NA dan kation -04 Pem$rnian !NA% men$r$t #e$gin and Hartley -1@<.4 6alah 6at$ metode yang dig$nakan adalah )re6i)ita6i ethanol - grain - grain alcohol alcohol 4 4 !eter"en komer6ial -6etiltrimetilamoni$m bromida% S!S4 men$r$t ,ahl and M Pfenni Pfenninge ngerr -1@@24 -1@@24 mengan mengand$n d$ng g 9am)$ 9am)$ran ran deter deter"en "en -yang -yang diran9 diran9ang ang $nt$k $nt$k menghil menghilangk angkan an bahan bahan organik4% organik4% enim enim -mi6alnya -mi6alnya )rotea6e% )rotea6e% li)a6e4 li)a6e4 dan kom)lek kom)lek66 )engkelat -mi6alnya E!TA4 E!TA4 6ehingga da)at membant$ )ro6e6 i6ola6i !NA dengan lebih efektif dan efi6ien Sedangkan k$antita6 !NA da)at dihit$ng 6e9ara k$antitatif mengg$nakan metode Ethidi$m>,romide ?l$ore69ent A66ay -,oyer% 8/184
"+ Ala& Ala& dan dan Bah Bahan an
Alat( 1 ,lender 8 Timbanga ngan 0 Pi6a$ Gela6 $k $k$r 5. Beaker ker gl glass 6. ,atang )engad$k . *orong Ka9a !. Pi)et tete6 ". Kain Saring #$. S)at$la
,ahan( 1 ,$ah 7e 7er$k 8 ,$ah ,$ah Sem Semangk angkaa 0 ,$ah Me Melon !et !eter"e er"en n b$b b$b$k $k . !et !eter"e er"en n 9air 9air 2 !et !eter"e er"en n krim krim 3 N a * l < A+$ade6 @ Alkoh Alkohol ol ab6ol ab6ol$t $t ding dingin in 1/ Kerta6 Kerta6 6aring 6aring
##. ##. Tab$ng Tab$ng =eak6i #%. Pera6an "er$k
$+ Pros Prosed edur ur Ke Ker ra a 1& I6ola6i !NA ,$ah 7er$k
!i6ia)kan alat dan bahan yang di)erl$kan $nt$k i6ola6i !NA b$ah 7er$k
,$ah 7er$k di)era6 dan ditimbang 6ebanyak 0// gram Air Pera6an "er$k ter6eb$t lal$ di6aring 6ebanyak 0 kali% 6aringan )ertama dengan kain 6aring dan 6aringan ked$a dan ketiga dengan kerta6 6aring Air "er$k yang telah di6aring 0 kali ter6eb$t dima6$kkan ke 0 beaker gla66 6ebanyak ma6ing>ma6ing 0/ mL lal$ ditambah 1 6)at$la detergen b$b$k% deter"en 9air% dan deter"en krim yang telah lar$t
*am)$ran ter6eb$t dihomogenkan dengan hati>hati agar tidak terbent$k b$ih
!itambahkan Na*l 6ebanyak 1 6)at$la lal$ 9am)$ran kembali dihomogenkan !iambil 1/ mL 9am)$ran air "er$k yang telah di6aring C deter"en b$b$k% air "er$k yang telah di6aring C deter"en krim% air "er$k yang telah di6aring C deter"en 9air dan dima6$kkan dalam tab$ng reak6i yang berbeda !itambah alkohol ab6ol$t dingin 6ebanyak . ml ke dalam ma6ing>ma6ing tab$ng reak6i dengan hati>hati melal$i dinding tab$ng reak6i !iamati bent$k 9in9in !NA yang telah dii6ola6i dan ke9e)atan ;akt$ )embent$kan 9in9in mengg$nakan 6to);at9h Ha6il ter6eb$t di9atat )ada tabel )engamatan
2& I6ola6i !NA ,$ah Semangka
!i6ia)kan alat dan bahan yang di)erl$kan $nt$k i6ola6i !NA b$ah Semangka ,$ah Semangka ditimbang 6ebanyak 0// gram% ditambahkan air 6ebanyak 8// mL lal$ diblender Air Semangka ter6eb$t lal$ di6aring 6ebanyak 0 kali% 6aringan )ertama dengan kain 6aring dan 6aringan ked$a dan ketiga dengan kerta6 6aring Air 6emangka yang telah di6aring 0 kali ter6eb$t dima6$kkan ke 0 beaker gla66 6ebanyak ma6ing>ma6ing 0/ mL lal$ ditambah 1 6)at$la detergen b$b$k% deter"en 9air% dan deter"en krim yang telah lar$t
*am)$ran ter6eb$t dihomogenkan dengan hati>hati agar tidak terbent$k b$ih
!itambahkan Na*l 6ebanyak 1 6)at$la lal$ 9am)$ran kembali dihomogenkan !iambil 1/ mL 9am)$ran air 6emangka yang telah di6aring C deter"en b$b$k% air 6emangka yang telah di6aring C deter"en krim% air 6emangka yang telah di6aring C deter"en 9air dan dima6$kkan dalam tab$ng reak6i yang berbeda !itambah alkohol ab6ol$t dingin 6ebanyak . ml ke dalam ma6ing>ma6ing tab$ng reak6i dengan hati>hati melal$i dinding tab$ng reak6i !iamati bent$k 9in9in !NA yang telah dii6ola6i dan ke9e)atan ;akt$ )embent$kan 9in9in mengg$nakan 6to);at9h Ha6il ter6eb$t di9atat )ada tabel )engamatan
& I6ola6i !NA ,$ah Melon
!i6ia)kan alat dan bahan yang di)erl$kan $nt$k i6ola6i !NA b$ah melon ,$ah melon ditimbang 6ebanyak 0// gram% ditambahkan air 6ebanyak 8// mL lal$ diblender Air melon ter6eb$t lal$ di6aring 6ebanyak 0 kali% 6aringan )ertama dengan kain 6aring dan 6aringan ked$a dan ketiga dengan kerta6 6aring Air melon yang telah di6aring 0 kali ter6eb$t dima6$kkan ke 0 beaker gla66 6ebanyak ma6ing>ma6ing 0/ mL lal$ ditambah 1 6)at$la detergen b$b$k% deter"en 9air% dan deter"en krim yang telah lar$t
*am)$ran ter6eb$t dihomogenkan dengan hati>hati agar tidak terbent$k b$ih
!itambahkan Na*l 6ebanyak 1 6)at$la lal$ 9am)$ran kembali dihomogenkan !iambil 1/ mL 9am)$ran air melon yang telah di6aring d i6aring C deter"en b$b$k% air melon yang telah di6aring C deter"en krim% air melon yang telah di6aring C deter"en 9air dan dima6$kkan dalam tab$ng reak6i yang berbeda !itambah alkohol ab6ol$t dingin 6ebanyak . ml ke dalam ma6ing>ma6ing tab$ng reak6i dengan hati>hati melal$i dinding tab$ng reak6i !iamati bent$k 9in9in !NA yang telah dii6ola6i dan ke9e)atan ;akt$ )embent$kan 9in9in mengg$nakan 6to);at9h Ha6il ter6eb$t di9atat )ada tabel )engamatan
#+ Da&a dan %asil %asil Penga Pengama&a ma&an n Tabel Tabel 1 Ha6il Pengamatan Peng amatan I6ola6i !NA
No
Nama ,$ah
7eni6 !eter"en
&akt$ K$antita6 terbent$k !NA
Keteranga n
Gambar
!NA -64
1
8
0
7er$k
Semangka
Melon
,$b$k
C
,enang
*air
11
CC
,enang
Krim
.
CCC
,enang
,$b$k
13
CCC
Kab$t
*air
2
C
Ka)a6
Krim
21
CC
,enang
,$b$k
83
CCC
Kab$t
*air
1
CC
Kab$t
Krim
1
C
Kab$t
Keterangan( C D 6edikit CC D 6edang CCC D banyak D !NA yang teri6ola6i %+ Anali Analisis sis Da&a Da&a Pada )raktik$m ini% !NA yang akan dii6ola6i diambil dari tiga ma9am b$ah yakni b$ah "er$k% b$ah 6emangka% dan b$ah melon Sebel$mnya% diambil 6ari b$ahnya terlebih dah$l$ dengan 9ara memblender ata$ di)era6 dan mer$6ak
dinding 6el b$ah% 6etelah it$% ditambahkan deter"en krim% b$b$k% dan 9air )ada 0/mL 6ari b$ah yang berbeda>beda yang bert$"$an $nt$k meli6i6kan membran 6el% kem$dian di9am)$rkan Na*l dan alkohol ab6ol$te dingin agar terbent$k )re6i)ita6i !NA% "eni6 )re6i)ita6i ada tiga yakni( kab$t% benang dan ka)a6 yang terbent$k diantara la)i6an 6ari b$ah -berada di bagian ba;ah4 dan la)i6an alkohol ab6ol$te dingin -la)i6an ata64 Pada detergen b$b$k% ke9e)atan teri6ola6inya !NA b$ah "er$k adalah
I+ Pem.ahasan
,erda6arkan anali6i6 diata6% ha6il i6ola6i !NA )ada 6etia) "eni6 b$ah berbeda 6e9ara k$ant k$antit ita6 a6%% bent bent$k $k dan dan d$ra6 d$ra6ii ;akt ;akt$ $ yang yang di)e di)erl rl$ka $kan n dalam dalam mengi mengi6o 6ola la6i 6i !NA !NA tergant$ng dari )ro6ed$r yang dilak$kan Men$r$t Hildebrand -8/124 Se9ara $m$m% )ro6e6 ek6trak6i !NA dari inti 6el memerl$kan bebera)a taha)an 6e)erti berik$t ini(
1 Per$6a Per$6akan kan 6el dan membran membran n$kle$6 n$kle$6 6e9ara 6e9ara mekanik mekanik -)en9am -)en9am)$r )$ran an&len'ing &len'ing % )en9am)$ranmixing )en9am)$ranmixing 4 dan 6e9ara kimia -deter"en4 8 Pemi6 Pemi6aha ahan n )$in )$ing g 6el$ 6el$la larr dari dari !NA !NA -den -dengan gan filt filtra ra6i 6i%% ber6 ber6if ifat at o)6i o)6iona onall di bebera)a )ro6ed$r4 0 Pengenda)an Pengenda)an dan )engg$m)a )engg$m)alan lan rib$an rib$an molek$l molek$l !NA !NA mengg$nakan mengg$nakan alkohol alkohol Pada )raktik$m kali ini dig$nakan detergent dengan 0 ma9am -b$b$k% 9air dan krim4 6ebagai faktor )embanding dari ha6il i6ola6i !NA% karena )ada da6arnya )engg$naan detergent% 6ham)oo% 6ab$n 9$9i )iring% dll da)at melar$tkan membran 6el yang ter6$6$n dari li)id bilayer
S$mber ( St$eber% 8//3 Molek$l 6ab$n "$ga li)id% 6e)erti molek$l )eny$6$n membran 6el% teta)i memiliki 6at$ )erbedaan $tama% yait$ bagian hidrofilik -head% ;ater>loFing4 lebih mam) mam)$ $ lar$ lar$tt dala dalam m air air nam$n nam$n "$ga "$ga ma6i ma6ih h memi memili liki ki 6edi 6ediki kitt 6ifa 6ifatt hidr hidrof ofobi obik k -tail%;ater>hating4 !engan ini berarti bah;a mereka ma6ih ber6ifat lipi' lipi' eno(gh eno(gh $nt$k ber9am)$r dengan li)id )ada membran 6el% teta)i "$ga ber6ifat )ater )ater eno(gh eno(gh $nt$k $nt$k ber9am ber9am)$r )$r dengan dengan air di 6ekita 6ekitarr membran membran%% 6ehing 6ehingga ga molek$l molek$l 6ab$n 6ab$n ata$ ata$
deter"en deter"en )indah ke dalam membran membran dan memi6ahkan memi6ahkan air dan li)id 6ehingga men"adi berminyak% dan membent$k gelemb$ng 6ab$n -St$eber% 8//34
S$mber ( St$eber% 8//3 Sebel$m mema6$ki )ro6e6 filteri6a6i% kadangkala diberi )erlak$an )$rifika6i yang bert$"$an $nt$k memi6ahkan !NA dari )rotein )elind$ngnya -hi6ton4 maka akan diha6ilkan i6ola6i !NA yang lebih m$rni dengan menambahkan enim )rotea6e -brome -bromeali alin n ata$ )a)ain4 )a)ain4 Pengg$n Pengg$naan aan alkohol alkohol yang yang dingin dingin "$ga "$ga berf$n berf$ng6i g6i $nt$k $nt$k menonaktifkan bebera)a enim yang memb$ngk$6 !NA DNAase* -DNAase* 6ehingga enim ter6 ter6eb eb$t $t
akan akan
m$da m$dah h
dihi dihila lang ngka kan n
-G -G
*arb *arbon oni% i%
8//3 8//34 4
Pemb Pember eria ian n
gara garam m
mem$ngkinkan $ntai !NA $nt$k teta) ber6ama>6ama ata$ mengenda)% karena m$atan )o6itif natri$m6odi$m natri$m6odi$m berinterak6i berinterak6i dengan g$g$6 fo6fat fo6fat yang berm$atan berm$atan negatif )ada $"$ng .5 $ntai !NA $nt$k menetrali6ir molek$l% 6ehingga memb$at !NA k$rang lar$t terhada) 9am)$ran air alkohol -I6i6% 8//4% 6edangkan men$r$t Hildebrand -8/124 garam da)at melind$ngi fo6fat negatif )ada $"$ng !NA% yang mem$ngkinkan $"$ng $ntai !NA ter6eb$t $nt$k datang lebih dekat -menggerombol4 6ehingga !NA da)at mengenda) dari lar$tan alkohol yang d ingin
!NA tidak akan lar$t dalam alkohol% ketika !NA berada di 9am)$ran garam -6alty ;ater4 akan berbent$k lar$tan% teta)i ketika ter)a)ar dengan alkohol akan membent$k enda)an -t(rns -t(rns into a soli' that +orms +rom a li(i' sol(tion4% sol(tion 4% 6edangkan 6em$a kom)onen 6el lainnya akan tertinggal dalam lar$tan garam -St$eber% 8//34
Grafk 1* 1" 1" 12 1 + +
/aktu / aktu te rbentuk DNA ('e0ond)
-eruk *"
'emangka
*1
.elon
* "2 1 " 11
2
1" %
Detergent ubuk
-enis Dete rgent
uantit uantitas as DNA
-uml umlah ah ()
&% 2&% 2 1&% 1 &%
2
1
-eruk
2 1
'emangka
.elon
2 1
K$antita6 !NA yang ditem$kan )ada berbagai "eni6 b$ah di)engar$hi oleh ti)e )loidi yang dimiliki% 9ontohnya 6a"a b$ah 6tro;beri yang memiliki berbagai ma9am ma9am )loidi )loidi hingga 6)e6ie6 6)e6ie6 yang '9ta)loi '9ta)loid d !e9a)l !e9a)loid oid 6erti 6erti 6)e9ie 6)e9ie66 ragaria casca'ensis yang casca'ensis yang ditem$kan oleh KE H$mmer di )eg$n$ngan 9a69ade -H$mmer% 8/184% begit$)$la dengan b$ah yang kami $"i 6e)erti 6emangka yang kebanyakan telah ber6ifat tri)loid -I6htia+% 8/104 ,erda6arkan ,erda6arkan grafik diata6 diata6 d$ra6i d$ra6i ;akt$i6ola6 ;akt$i6ola6ii !NA ter9e)at ter9e)at dimiliki dimiliki oleh b$ah "er$k% dikarenakan kand$ngan air dari b$ah "er$k lebih 6edikit "ika dibandingkan dibandingkan dengan b$ah 6emangka 6emangka ata$)$n melon dan 6emakin 6emakin tinggi kadar air maka 6el yang terlar$t di dalam ek6trak akan 6emakin 6edikit% 6ehingga !NA yang ter)reti6i)a6i "$ga akan 6edikit Keadaan alkohol "$ga ber)engar$h dalam )ro6e6 )engg$m)alan !NA karena )ada 6aat )raktik$m 6$h$ alkohol tidak 6tabil
J+ Kesi esimpul mpula an
Terda)at 0 taha) i6ola6i !NA% yait$ -14 Peme9ahan 6el dan membran 6e9ara mekani mekanik k dan kimia; kimia;i i -84 Pemi6a Pemi6ahan han dan )$rifi )$rifika6 ka6ii agar agar !NA ter)i6a ter)i6ah h dengan dengan )rotein dan 6$b6tan6i 6el -04 Pengenda)an dan )engg$m)alan !NA oleh alkohol 6ehingga da)at membent$k 6tr$kt$r kha6 -kab$t% ka)a6% benang dll4 ,$ah "er$k memiliki d$ra6i ;akt$ ter9e)at dalam )ro6e6 i6ola6i !NA dengan ;akt$ . detik mengg$nakan detergent 9ream K+ Saran
Sehar$6nya ;akt$ yang di6ediakan $nt$k mengamati )ro6e6 )emi6ahan !NA lebih lama agar !NA da)at lebih "ela6 terlihat% kem$dian dalam )ro6e6 )engamatan $6ahakan $nt$k memanfaatkan ;akt$ 6ebaik m$ngkin dalam kegiatan agar ker"a lebih efektif L+ Diskusi
14 A)akah A)akah yang yang dimak6 dimak6$d $d dengan dengan i6ola i6ola6i 6i !NA !NA J 7a;ab (
I6ola6i !NA adalah teknik yang bert$"$an $nt$k mem)eroleh !NA m$rni m$rni dari dari 6$at$ 6$at$ organi organi6me 6me baik baik he;an he;an ma$)$n ma$)$n t$mb$ha t$mb$han% n% metode metode yang yang )aling )aling 6ederh 6ederhana ana adalah adalah dengan dengan mengg$ mengg$naka nakan n 9ara mekani mekanik k dan 6ehing 6ehingga ga da)at da)at meme9ah meme9ahkan kan dindin dinding g 6el% 6el% membran membran )la6ma dan membran inti% kem$dian diberi alkohol akar !NA mengg$m)al dan ter)i6ah dari molek$l lainnya 84 A)a f$ng6 f$ng6ii )enamb )enambaha ahan n deterg detergent ent J 7a;ab( #engg$naan detergent% 6ham)oo% 6ab$n 9$9i )iring% dll da)at
melar$tkan membran 6el yang ter6$6$n dari li)id bilayer Karena )ada deterg detergen en mengand mengand$ng $ng 6odi$m 6odi$m dode6il dode6il 6$lfat 6$lfat - S!A 4 yang yang da)at da)at menyebabkan hilangnya molek$l li)id )ada membran 6el 6ehingga 6tr$kt$r membran akan r$6ak dan meli6i6kan i6i 6el 6ehingga !NA akan terek6)o6e kel$ar 6el
04 A)akah A)akah f$ng6 f$ng6ii dari dari )enamb )enambahan ahan gara garam mJ 7a;ab ( Pembe Pemberi rian an gara garam m mem$ mem$ng ngki kink nkan an $nta $ntaii !NA !NA $nt$ $nt$k k teta teta) ) ber6ama>6ama
ata$
mengenda)%
karena
m$atan
)o6itif
natri$ natri$m6 m6odi odi$m $m berint berinterak erak6i 6i dengan dengan g$g$6 g$g$6 fo6fat fo6fat yang yang berm$a berm$atan tan negatif )ada $"$ng .5 $ntai !NA $nt$k menetrali6ir molek$l% 6ehingga memb$at memb$at !NA k$rang k$rang lar$t lar$t terhada terhada) ) 9am)$r 9am)$ran an air alkohol alkohol dan gara garam m da)at da)at meli melind nd$ng $ngii fo6f fo6fat at negat negatif if )ada )ada $"$n $"$ng g !NA% !NA% yang yang mem$ngkinkan $"$ng $ntai !NA ter6eb$t $nt$k datang lebih dekat -menggerombol4 6ehingga !NA da)at mengenda) dari lar$tan alkohol yang dingin 4 A)ak A)akah ah f$ng f$ng6i 6i )ena )enamb mbah ahan an alko alkoho holJ lJ Meng Menga) a)aa
alko alkoho holl
yang ang
ditambahkan har$6 dalam keadaan dinginJ 7a;ab ( Penamba Penambahan han alkohol alkohol dingin dingin akan akan mem)erm mem)erm$dah $dah koag$la koag$la6i 6i !NA 6ehingga !NA yang ber6ifat tran6)aran da)at terlihat dengan
"ela6 ber$)a benang>benang hal$6 )ada la)i6an tengah 9am)$ran b$ah dan detergen% 6elain it$ "$ga karena )ada alkhohol yang dingin da)at membent$ mem)er9e)at )ro6e6 mem)ertifika6i !NA dan )engg$naan alkohol yang dingin "$ga berf$ng6i $nt$k menonaktifkan bebera)a enim yang memb$ngk$6 !NA - DNAase* DNAase* 6ehingga enim ter6eb$t akan m$dah dihilangkan .4 Menga) Menga)aa )engad$ )engad$kan kan 9am)$ran 9am)$ran 6etela 6etelah h ditamb ditambahk ahkan an deterg detergent ent tidak boleh 6am)ai berb$6aJ 7a;ab ( Karena b$6a yang ditimb$lkan oleh detergen akan menggangg$ )engamatan% dan !NA yang berha6il dii6ola6i akan nam)ak ti)i6% b$6a yang terlal$ banyak akan memb$at !NA ter6eb$t tert$t$) karena b$6a yang terbent$k akan memb$at !NA ter)erangka) dan ik$t terlar$t didalamnya 24 A)akah ke9e)ata ke9e)atan n )enggab$ngan )enggab$ngan !NA )ada ma6ing>m ma6ing>ma6ing a6ing b$ah b$ah dan ma6ing>ma6ing detergent berbedaJ Menga)aJ 7a;ab ( ,erbeda ,erbeda%% karena karena "eni6 "eni6 b$ah dan "eni6 "eni6 deter detergen gen ber)eng ber)engar$ ar$h h terh terhad ada) a) ha6i ha6ill i6ol i6ola6 a6ii !NA !NA !NA !NA )ada )ada ma6i ma6ing ng>m >ma6 a6in ing g b$ah b$ah mem)$n mem)$nya yaii kadar kadar ata$ ata$ "$ml "$mlah ah yang yang berb berbed edaa dan ;arn ;arnany anyaa )$n )$n berbeda *ontohnya ,$ah "er$k yang memiliki d$ra6i ;akt$ ter9e)at dalam dalam )ro6 )ro6e6 e6 i6ol i6ola6 a6ii !NA !NA deng dengan an ;akt ;akt$ $ . deti detik k mengg mengg$n $naka akan n detergent 9ream karena b$ah "er$k memiliki kand$ngan air yang lebih 6edikit dari)ada b$ah 6emangka dan melon 34 A)akah ke6im)$lan ke6im)$lan dari dari )raktik$ )raktik$m m i6ola6i i6ola6i !NA J 7a;ab( Terda)at 0 taha) i6ola6i !NA% yait$ -14 Peme9ahan 6el 6el dan dan memb membra ran n 6e9a 6e9ara ra meka mekani nik k dan dan kimi kimia; a;i i -84 -84 Pemi6 Pemi6aha ahan n dan dan )$ri )$rifi fika6 ka6ii agar agar !NA !NA ter) ter)i6 i6ah ah deng dengan an )rotein
dan
6$b6tan6i
6el
-04
Pengenda)an
dan
)engg$m)alan !NA oleh alkohol 6ehingga da)at membent$k 6tr$kt$r kha6 -kab$t% ka)a6% benang dll4 ,$ah "er$k memiliki d$ra6i ;akt$ ter9e)at dalam )ro6e6 i6ola6i !NA dengan ;akt$ . detik mengg$nakan detergent 9ream
M+ Da/&ar Da/&ar Ruukan Ruukan
,ahl and M Pfenninger 1@@2 A ra)id method of !NA i6olation i6olation $6ing la$ndrydetergent x+or' University /ress N(cleic Aci's 0esearch, #""6, 1ol. %2, No. #5!3#5!! ,oyer 8/18 Biochemistry 8/18 Biochemistry La&oratory4 o'ern Theory an' Techni(es Techni(es %n' 7'ition* %n' 7'ition 7'ition ,o6ton( Pear6on Prenti9e Hall ?aatih% M$khli66$l 8//@ IS'LASI !AN !IGESTI !NA K='M'S'M -IS'LATI'N AN! !IGESTI'N '? *H='M'S'MAL !NA4 8(rnal !NA4 8(rnal /enelitian 9ains : Teknologi, Teknologi, ol ol 1/% No 1% 8//@( 21 > 23 G *arboni 8//3 ;o) 8//3 ;o) to 7xtract DNA rom r(its Te:t r(its Te:t editing by !onald !e6a !e6a$l $lnie nier6 r6%%
Ph! Ph!
htt)(;;;f$n69i9omf$n0endnadnaenhtm
-diak6e6 8< maret 8/134 Hildebrand% !aFid% Serdo% S9ott 8/12 1.
I6htia+% Ahmad et al. 8/10 Mor)hologi9al !i66imilarity ,et;een Tetra)oloid and !i)loi !i)loid d &aterm atermelo elon n -=itr(ll(s =itr(ll(s lanat(s lanat(s Th$ Th$nb nb4 4 >orl' >orl' Applie' 9ciences 8o(rnal 81 -24( <.<><21 I6i6 M =amOre% N N =odrOg$e% 7$liette ald6>Infante% ald6>Infante% Mari9ela *a)ote% ! ,e9ker and & =ohde 8// IS'LATI'N '? GEN'MI* !NA6 ?='M ?='M THE T='PI* T='PI*AL AL ?=UIT ?=UIT T=EES T=EES A'*A!'% '*A!'% *'*'NU *'*'NUT% T% GUA GUAA AN!
MANG MANG' '
?'= ?'=
P*=> P*=>,A ,ASE SE! !
!NA MA= MA=KE= KE=
APPLI*ATI'N =(ltivos Tropicales. Fol Tropicales. Fol 8.% no 1% ) 00>0< Le;in% , -8//<4 ?enes <@ S$db$ry( 7one6 ,artlett P$bli6her6 Lodhi% M$hammad A( G$ang>Ning Be% Norman ? &eeden% &eeden% and ,r$9e I =ei69h A 1@@ Sim)le and Effi9ient Effi9ient Method for !NA E:tra9tion from from Gra)eFine *$ltiFar6 and 1itis S)e9ie6 /lant S)e9ie6 /lant olec(lar Biology 0eporter )age6 0eporter )age6 2Q10 18 -14 1@@ *ommentary =ee9e et al 8/1/.=amp&ell 8/1/.=amp&ell Biology Tenth Tenth 7'ition. USA ( Pear6on Ed$9ation% In9 St$eber% Nan9y 8//3 DNA 8//3 DNA 7xtraction 7xtraction Portland ( 'MSI B$lianti B$lianti 8//2 Pengembangan Teknik I6ola6i !NA T$mb$han Mengg$nakan !etergen Komer6ial Tidak diterbitkan !i)re6enta6kan dalam SEMINA= NASI'NAL MIPA 8//2 dengan tema Penelitian% Pendidikan% dan Penera)an MIPA 6erta Peranannya dalam Peningkatan Ke)rofe6ionalan Pendidik dan Tenaga Ke)endidikan yang di6elenggarakan oleh ?ak$lta6 Matematika dan Ilm$ Pengetah$an Alam UNB% Bogyakarta )ada tanggal 1 Ag$6t$6 8//2 #e$gin 7A% Hartley 7L 1@<. Ethanol Pre9i)itation of !NA. !NA. oc(s. 2*4 #3%. 0etrieve' %$$!-$"-#$
LAMPIRAN
