VARIACIONES EN LA ESTRUCTURA DEL DNA .
Estructuras en doble hélice.
La molécula de DNA no es una estructura estática, sino flexible y dinámica. Gracias a la capacidad de rotación alrededor de los enlaces de los nucleótidos, el DNA puede adoptar in vivo diversas formas, distintas de la forma B de Watson y Crick . Diapositiva2. https://es.scribd.com/doc/103594270/0-1tema-6-Variaciones-en-LaEstructura-Del-Dna El ADN existe en muchas conformaciones. Sin embargo, en organismos vivos sólo se han observado las conformaciones ADN-A, conformaciones ADN-A, ADN-B ADN-B y ADN-Z. ADN-Z. La conformación que adopta el ADN depende de su secuencia, la cantidad y dirección de superenrollamiento que presenta, la presencia de modificaciones de modificaciones químicas en las bases y las condiciones de la solución, tales como la concentración de iones de metales de metales y poliaminas. poliaminas. De las tres conformaciones, la forma "B" es la más común en las condiciones existentes en las células. Las dos dobles hélices alternativas del ADN difieren en su geometría y dimensiones
En la conformación más común que adopta el ADN aparecen, como consecuencia de los ángulos formados entre los azúcares los azúcares de ambas cadenas de cada par de bases nitrogenadas, dos tipos de hendiduras alrededor de la superficie de la doble hélice: una de ellas, la hendidura o surco mayor, que mide 22 Å 22 Å (2,2 nm) (2,2 nm) de de ancho, y la otra, la l a hendidura 51 o surco menor, que mide 12 Å (1,2 nm) de ancho . Cada vuelta de hélice, que es cuando ésta ha realizado un giro de 360º o lo que es lo mismo, de principio de hendidura mayor a final de hendidura menor, medirá por tanto 34 Å, y en cada una de esas vueltas hay unos 10,5pb. 10,5pb. http://www.ecured.cu/index.php/ADN
Variantes en doble hebra: forma A y Z
ADN-A Estructura de la doble hélice Se trata de una doble hélice dextrógira, al igual que el ADN-B, con un surco menor poco profundo y un poco más amplio que el surco mayor, que es más profundo. En comparación a la doble hélice del ADN-B, ésta es más abierta, tiene mayor diámetro y una disposición de las bases nitrogenadas más alejada del eje de la hélice. Las bases nitrogenadas están muy inclinadas respecto de la horizontal, más próximas entre sí y localizadas más simétricamente respecto al centro. Ver (fig 2)
http://es.wikipedia.org/wiki/ADN-A Figura #2
ADN-Z.
Es una forma de doble hélice levógira (con giro hacia la izquierda) con una conformación del esqueleto en zig-zag. Es una variación que puede realizar el A DN. Ver (fig 3) Estructura.
Es una doble hélice con enrollamiento hacia la izquierda, tiene 12 pares de bases por giro completo, se puede observar en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas (GCGCGC), debido a la conformación alternante de los residuos azúcar-fosfato sigue un curso en forma de zig-zag. Requiere una concentración de cationes superior a la del ADN-B. Los grupos fosfato se encuentran más cerca entre ellos a comparación de la forma ADN-B. La conformación Z está favorecida por un elevado contenido en G-C. Las secuencias de ADN pueden pasar de la forma B hacia la forma Z y viceversa. Sólo se observa un surco, el emparejamiento entre las bases (que forman el surco mayor cercano al eje- en la forma ADN-B) está hacia un lateral, en la superficie exterior, lejos del eje. Formación del ADN-Z
La formación del ADN-Z se produce durante la transcripción de genes, en los puntos de inicio de la transcripción cerca de los promotores de genes que se transcriben de manera activa. Durante la transcripción, el movimiento de la ARN polimerasa induce una superhelicoidización negativa en la parte anterior o corriente arriba y una superhelicoidización en la parte posterior o corriente debajo de la transcripción. La superhelicoidización negativa corriente arriba favorece la formación del ADN-Z; una función posible del ADN-Z podría ser absorber esta superhelicoidización negativa. Al final de la transcripción, la topoisomerasa relaja la estructura del ADN volviendo a la conformación B. http://es.wikipedia.org/wiki/ADN-Z
Figura #3
Comparaciones entre los tres tipos estructurales básicos del DNA en doble hebra. Ver (fig1)
Figura #1
VARIANTES LOCALES DE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL B-DNA
Palíndromos.
Aquellas regiones de un DNA cuya secuencia es la misma en ambas hebras. La secuencia de una hebra, leída de izquierda a derecha, es igual que la de la otra hebra, leída de derecha a izquierda. Ver (fig 4) Figura #4
Palíndromos interrumpidos son aquellos en los cuales una pequeña secuencia separa las dos mitades y actúa, por tanto, como centro de simetría no puntual. Ver (fig 5) Figura #5
Motivos estructurales responsables de la unión del DNA con Proteinas.
Hélice-giro-hélice Formado por dos segmentos peptídicos en α -hélice separadas por una secuencia flexible
de aminoácidos. Pueden presentarse dos motivos o asociarse dos proteínas (dímeros) con su propio HTH (distancia de 3.4nm). Ver (fig 6) Actúan regulando procesos de transcripción en bacterias (AMP cíclico) y virus (proteína Cro del fago lambda)
Figura #6
Hélice-Bucle-Hélice
Ver (fig 7) También dos segmentos, pero con un péptido que los une más largo. Formación de proteínas diméricas. Proteína Max de ratón.
Figura #7
