RESUMEN
Directo Montaje de datos de velocidad de sedimentación con soluciones numéricas de las ecuaciones Lamm ha sido explotada para obtener los coeficientes de sedimentación para solutos individuales en condiciones en las mesetas de disolvente o de solución no son bien disponibles o son transitorios. La evolución calculada fue inicializado con la primera exploración experimental y de regresión no lineal fue empleado para obtener los valores de ajuste óptimo para los coeficientes de sedimentación y difusión. Propiedades generales de la Lamm Se examinaron las ecuaciones como herramientas de análisis de datos.
INTRODUCCION
El coeficiente de sedimentación de una macromolécula es la tasa de sedimentación de la molécula en una unidad de campo gravitacionales. El valor de s para una macro molécula depende de su tamaño, forma, grado de hidratación, y concentración. Por lo tanto el valor del coeficiente de sedimentación de, por ejemplo, una proteí na na normalmente se da para la proteí na na en dilución infinita en agua a 20 ° C. Recientemente, se ha prestado cada vez m ás atención a la desarrollo de métodos de sedimentación para el análisis de pequeña proteí nas nas y péptidos (Behlke y Ristau, 1997; Philo,1997). Esto ha sido estimulado en parte por el descubrimiento de una serie de proteí nas nas inmunológicamente activas (Philo, 1997), y la mayor disponibilidad de los dominios de proteí nas nas aisladas y péptidos sintéticos como modelos para el plegamiento de proteí nas. nas. El coeficiente de sedimentación es conocido como s o Svedberg , es una medida del tiempo que tarda en centrifugar una partí cula, cula, sometida a un campo centrifugo. En una centr í fuga fuga hay tres fuerzas, la fuerza centrí fuga, fuga, la fuerza de fricción y la fuerza de flotación por el principio de Arquí medes. medes. Fuerza centrifuga 2
velocidad ad angula angular, r, y x la distan distancia cia de la organela, organela, al eje que se F c = m w x , donde w es la velocid moviendo. Fuerza de fricción
F f
fv
6 πηr
, la fuerza de friccion es contraria a la velocidad, se rige por la ley de Stokes, ƞ es el coeficiente de fricción, y r es el radio. Fuerza de flotación =−
F b
=−
( )
m 2 ρ w x , Siendo pm, la densidad de la partí cula cula , y p la densidad del agua. ρm
=−
Una partí cula cula dentro de un campo centrifugo, esta sometida a las siguientes fuerzas 2
m w x −6 πηr Sustituimos
ρm 4 3πr
3
( )
dx m 2 − ρ w x =0 dt ρm ρm 4
m=
3π r
3
4 2
−
w x
3π r
3
2
=
ρ w x ρm ρ dx 4 3 2 dt 3 π r ρ w x 6 πηr 2 2r dx = v = 2 dt 9 η ( ρm − ρ ) w x
Un
9η
2
=
2
( ρm − ρ )
v = s w x
dt
( ) −
2r
6 πηrdx
le llamamos una constante que es s
Despejando obtenemos la Definición del coeficiente de sedimentación s
s
=
v 2
w x
Que depende mucho del radio de la partí cula. Cuando el radio es grande la partí cula sedimentara, a mayor velocidad. Vemos como una partí cula grande esta menos expuesta a la fricción. A su vez cuanto mayor sea la densidad de la partí cula sedimentara mas rápido El coeficiente de sedimentación s, representa, la velocidad a la sedimentación que una partí cula, tiene para una aceleración unidad angular. Si vemos las unidades son segundos. Y la definición de S (Svedberg), en honor a quien contribuyo tanto al desarrollo del método de separación por ultracentrí fuga. Con base en lo anterior, el objetivo de este artí culo de revisión es recopilar los principios fundamentales del coeficiente de sedimentación en macromoléculas grandes y pequeñas con el fin de definir su relación con la masa molecular