Kuliah II 20 Maret 2007
Klasifikasi Virus
Influenza
Klasifikasi virus berdasarkan Family Asam nukleat
Family
Symetry
Envelope
dsDNA
I. Poxviridae
Complex
-
dsDNA
II. Iridoviridae
Icosahedral
-
dsDNA
III. Herpesviridae
Icosahedral
+
dsDNA
IV.. Adenoviridae IV
Icosahesral
-
dsDNA
V. Papovaviridae
Icosahedral
-
ssDNA
VI.Parvoviridae
Icosahedral
-
ssRNA
I. Picornaviridae
Icosahedral
-
ssRNA
II.Caliciviridae
Icosahedral
-
ssRNA
III.Togaviridae
Icosahedral
+
ssRNA
IV.Bunyaviridae
(Uncertain)
+
dsRNA
V. Reoviridae
Icosahedral
-
dsRNA
VI. Orthomyxoviridae
Helical
+
dsRNA
VII.Paramyxoviridae
Helical
+
dsRNA dsRNA
VIII.Rhabdoviridae
Helical
+
ssRNA
IX. Retroviridae
Icosahedral
+
ssRNA
X. Arenaviridae
Uncertain
+
ssRNA
XI. Coronaviridae
Helical
+
Miscelaneous
Klasifikasi berdasarkan jaringan yang di infeksi
Group
Bagian yang di infeksi (Penyakit)
Pneumotropic Respiratory system ( influenza, respiratory syncytial disease, adenovirus disease, rhinovirus infection) Dermotropic Skin and subcutaneous tissues (chickenpox, herpes simplex, measles, mumps, smallpox, rubella) Viscerotropic Blood and visceral organs (Yellow fever, dengue fever, infectious mononucleosis, cytomegalovirus disease, viral fevers, Marburg disease, viral gastroenteritis, hepatitis A, hepatitis B, AIDS) Neurotropic Central nervous system (Rabies, lymphocytic choriomeningitis, polio, slow virus disease, arboviral encephalitis)
Approximate size (nm)
Important disease
250
Smallpox, cowpox
200
Animal viruses
200
Herpes simplex, chickenpox, infectious mononucleosis,
75
respiratory infections, tumor in animal
50
Benign tumors (warts), Tumor in animal
20 27 40 50 100 180 150
Animal viruses Polio, coxsackievirus disease Hepatitis A Animal viruses Arboviral equine encephalitis, rubella, yellow fever, dengue fever Influenza, hepatitis B Rabies AIDS, NANB hepatitis
Perbandingan ukuran virus dengan m.o lain Approximate size (nm) 2800
Sel nukleus
2000
E. Coli
250
Small pox
240
Tobacco mosaic
150
Rabies
100
Influenza
95
Bacteriophage
70
Common cold
27
Polio
20
parvovirus
Influenza Name
of pandemic
Date
Asiatic (Russian) Flu
1889--90 1889
1 million
possibly H2N2
Spanish flu
1918--20 1918
40 million
H1N1
Asian flu
1957--58 1957
1 to 1.5 million
H2N2
Hongkong flu
1968--69 1968
0.75 to 1 million
H3N2
Death
subtype involved
Struktur virus influenza
Ortomiksoviradae merupakan determinan utama dari mobilitas dan mortilitas yang di sebabkan oleh penyakit pernapasan Semua ortomuksovirus yang di kenal adalah virus influenza Amplop yang terdiri dari dari Haemagglutinin dan Neuraminidase (H dan N) menentukan varian dari virus influenza
Partikel virus influenza mengandung tujuh protein struktural yang berbeda. berbeda. Tiga protein besar (PB1, PB2, dan PA) terikat pada RNA virus dan merupakan penyebab dari transkripsi dan replikasi dari RNA
Influenza
Influenza, Influenza, biasa di sebut flu.
Penyakit infeksi pada burung dan mamalia
Disebabkan oleh virus RNA (Fam. Ortomyxoviridae)
Pada manusia, gejala yang timbul adalah: demam, sakit tenggorokan, sakit pada otot, sakit kepala, batuk, and weakness and fatigue. fatigue. Pada kasus yang serius, influenza dapat menyebabkan pneumonia, pneumonia, yang mana akan fatal pada anak2 atau orang tua. Kadang2 agak mirip common cold, cold, influenza is a much more severe disease and is caused by a different type of virus. Although nausea and vomiting can be produced, especially in children,these symptoms are more characteristic of the unrelated gastroenteritis, gastroenteritis, which is sometimes called "stomach flu" or "24"24-hour flu".
Mekanisme Terjadinya Pandemi
Ada 6 fase: tidak terdapat subtype virus influenza baru yang terdeteksi pada manusia. Virus tsb terdapat pada hewan tetapi beresiko kecil untuk menginfeksi manusia Tidak terdeteksi subtype virus tsb pada manusia, tetapi beresiko besar untuk menginfeksi manusia Terjadi infeksi pada manusia oleh subtype virus baru, tetapi tidak terjadi penularan antar manusia, atau jarang sekali terjadi penularan pada kontak terdekat sekalipun Terjadi penularan antar manusia pada kelompok kecil(small cluster), tetapi hanya terlokalisir pada daerah yang terbatas. Hal ini mengesankan virus belum mampu beradaptasi pada tubuh manusia
Continue.. Terjadi penularan antar manusia pada kelompok yang lebih besar (larger cluster), tetapi masih pada daerah tertentu. Hal ini mengesankan virus sudah beradaptasi lebih baik pada tubuh manusia, tetapi belum dapat menyebar secara mudah Terjadi peningkatan penularan yang menetap pada populasi manusia secara umum.
Perkembangan H dan N:
1889 1889--1890: H2N2 (A2?) 1900 : H3N2 (A3) 1918 1918--1919: HswN1 1929: HswN1 1931: HswN1 1933: H0N1 (A0) England 1947: H0N1, H1N1 (A1) Australia 1950: H1N1 (A1 variant) 1957: H2N2 (A2) Singapore Asian flu) 1967: H3N2 (AHK) Hongkong 1976: HswN1, H3N2, New Jersey
1977: H1N1 (A1 variant ) China 1979 1979--1981: H3N2 Bangkok, H1N1 1983 1983--1985: H1N1 Chile, H3N2 Philippines
Avian Flu
Avian flu
also "bird flu", "avian influenza", "bird influenza", means "flu "flu from viruses adapted to birds", birds", but is sometimes mistakenly used to refer to both other flu subsets (such as H5N1 flu) flu) or the viruses that cause them (such as H5N1). H5N1). All known avian flu viruses belong to the species of virus called Influenza A virus. All subtypes (but not all strains of all subtypes) of Influenza A virus are adapted to birds, which is why for many purposes avian flu virus is the Influenza A virus (note that the "A" does not stand for "avian").
Secara genetik dapat dibedakan antara virus flu manusia dan virus flu avian, mencakup :
2: PB2:
RNA polymerase: polymerase: Amino acid (or residue (or residue)) position 627 in the PB2 protein encoded by the PB2 RNA gene. Until H5N1, H5N1, all known avian influenza viruses had a Glu at position 627, while all human influenza viruses had a lysine. lysine.
A: HA:
(hemagglutinin (hemagglutinin): ): Avian influenza HA bind alpha 22-3 sialic acid receptors while human influenza HA bind alpha 22 -6 sialic acid receptors. Swine influenza viruses have the ability to bind both types of sialic acid receptors.
H5N1
Sejak tahun 2006, H5N1 umum digunakan untuk avian flu, merujuk pada virus influenza A. Baru baru ini, strain ini di transmisikan melalui kontak dengan burung yang telah terinfeksi oleh virus ini, dan pada beberapa kasus, dapat dipindahkan dari satu manusia ke manusia lain. Sebenarnya, H5N1 sekarang bukan pandemic dan tidak dapat menyebabkan pandemic Hanya jika bentuk H5N1 bermutasi dan dapat dipindahkan dari satu manusia ke manusia lain dan menyebabkan pandemic.
Penyebaran H5N1
Penyebaran avian flu di dunia
Countries with poultry or wild birds killed by H5N1. Countries with human cases of H5N1.
Cumulate Human Cases
of and Deaths from H5N1 As of March 8, 2007
Notes: Source WHO Confirmed Human Cases of H5N1 "[T]he incidence of human cases peaked, in each of the three years in which cases have occurred, during the period roughly corresponding to winter and spring in the northern hemisphere. If this pattern continues, an upsurge in cases could be anticipated starting in late 2006 or early 2007." Avian influenza ± epidemiology of human H5N1 cases reported to WHO The regression curve for deaths is y a + ek x , and is shown extended through the end of April, 2007. =
Kasus kasus yang terjadi
2003 Mulai muncul lagi Januari 2003, sejak outbreak terakhir flu hongkong tahun 1997. tiga orang dalam 1 keluarga terinfeksi setelah mengunjungi kota Fujian dan 2 dari padanya meninggal (China). Pertengahan 2003 terjadi outbreak penyakit unggas yang disebabkan oleh H5N1 (asia). Des 2003, hewan di kebun binatang Thai mati setelah memakan daging ayam yang terinfeksi. Pada akhir tahun ini juga di deteksi virus ini di Korea
2004 Jan 2004, H5N1 ditemukan di Vietnam dan Thailand dan dalam beberapa minggu menyebar ke 10 bagian negara asia lain termasuk Indonesia, Korea selatan, jepang dan china. Oktober 2004 peneliti menetapkan H5N1 lebih berbahaya dibandingkan dari temuan sebelumnya yang diduga hanya menyerang ayam, itik, babi dan hewan unggas lain nya.
2005
2005
Pada jan 2005 an outbreak influenza avian menginfeksi 33 dari 64 kota dan propinsi di Vietnam. 1,2 juta unggas dibunuh. Lebih dari 140 juta burung dipercayai mati atau dibunuholeh karena outbreak ini. Pada April 2005 there begins an unprecedented diedie-off of over 6,000 migratory birds at Danau Qinghai di Cina over three months. Strain H5N1 menyebar melalui migrasi burung, lebih pada tidak kurang dari 10 bulan. In August 2005 H5N1 menyebar ke Kazakhstan, Kazakhstan, Mongolia and Russia. Russia.
2005
On September 29, 29, 2005, 2005, David Nabarro, Nabarro, the newly appointed Senior United Nations System Coordinator for Avian and Human Influenza, warned the world that an outbreak of avian influenza could kill 5 to 150 million people. David Nabarro later stated that as the virus had spread to migratory birds, an outbreak could start in Africa in Africa or the Middle East. East. Later in 2005 H5N1 spread to Turkey, Turkey, Romania, Romania, Croatia and Kuwait. Kuwait.
2006 y
y
y
y
Jan-feb 2006, H5N1 menyebar ke Janke Africa Africa and Europe melalui burung liar Penyebaran H5N1 yang patogen pada burung liar , pada burung di kebun binatang dan pada tempat2 lain, contohnya pada penjualan hewan (pet animals) terus meningkat. Tanpa menggunaan vaksin maka akan menyebabkan terbunuhnya jumlah hewan di peternakan dan di kebun binatang makin meningkat, sementara kebutuhan terhadap vaksin juga meningkat.
SARS
Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)
Kapan dan dimana pertama kalinya SARS dilaporkan ? : On 26 February 2003, a man was admitted to hospital in Hanoi with high fever, dry cough, myalgia (muscle soreness) and mild sore throat. Over the next four days he developed increasing breathing difficulties, severe thrombocytopenia (low platelet count) and signs of adult respiratory distress syndrome requiring ventilator support. A
Bagaimana symptoms SARS ? Demam tinggi (> 38° 38° Celsius) Batuk kering Susah bernafas Changes in chest XX-rays indicative of pneumonia also occur. SARS may be associated with other symptoms, including headache, muscular stiffness, loss of appetite, malaise, confusion, rash and diarrhoea.
Continue..
Bagaimana menangani pasien SARS? Pasien harus ditempatkan di ruang isolasi. Strict respiratory and mucusol barrier nursing is recommended. It is very important that suspected cases are separated from other patients and placed in their own hospital room. Health care workers and visitors should wear efficient filter masks, goggles, aprons, head covers, and gloves when in close contact with the patient. Hospital Infection Control Guidance
Seberapa cepat SARS menyebar ? : SARS appears to be less infectious than influenza. The incubation period is short, estimated to range from 22-7 days, with 3 3--5 days being more common. However, the speed of international travel creates a risk that cases can rapidly spread around the world.
A