CLASIFICACIÓN MICROBIANA
Mariana Herrera Díaz Microbiología y Bioanalisis ESCUELA DE MICROBIOLOGÍA
Evolución
Oxigenación de la atmosfera.
RNA
DNA
Tiempo de evolución
Microbiología Antonie Van Leeuwenhoek
“Animaculos” Louis Pasteur Teoría de la generación espontánea
Robert Koch Postulados de Koch
Microorganismos como células
Membrana celular. Núcleo o nucleoide. Proteínas.
Ácidos nucleicos. Lípidos. Polisacáridos.
Diferencias entre las células procariotas y las eucariotas CARACTERÍSTICAS Forma de vida
PROCARIOTAS
EUCARIOTAS
Bacterias
Todas excepto bacterias
Núcleo
Material nuclear presente pero no envuelto por membrana
Núcleo y membrana nuclear
Tamaño
1 a 10 µm
Más de 100 µm
Único, DNA circular
Múltiples pares de cromosomas presentes en el núcleo
Asexual por fisión binaria
División celular por mitosis, reproducción sexual por meiosis
Cromosoma División celular Compartimentos internos
Ribosomas
No hay compartimentos internos Organelas unidas por membrana Más pequeños que en eucariotes y no unidos a membrana
Unidos a membrana
Características de valor fenotípico 1. Morfología: Forma, tamaño y Gram. 2. Movilidad: móvil por flagelos, deslizamiento,
inmóvil. 3. Nutrición y fisiología: fotótrofo, quimiorganótrofo,
quimiolitótrofo; Temperatura óptima de crecimiento, requerimiento de sal y Ph. Otros factores: pigmentos, inclusiones, patogenicidad y sensibilidad a los antibióticos, contenido G-C.
Métodos moleculares Hibridación DNA-DNA
Ribotipado
FAME: Análisis de ácidos grasos.
Diversidad microbiana = Evolución Expresada por: Tamaño celular.
Morfología. Estrategias metabólicas. Movilidad.
Mecanismos de división celular. Adaptación a condiciones ambientales.
Diversidad Microbiana
Diversidad Metabólica
Diferentes clasificaciones Linneo 17353 2 reinos
Haeckel 18664 3 reinos
Chatton 19375 2 imperios
Prokaryota (no tratados)
Copeland 19569 4 reinos
Monera
Whittaker 19696 5 reinos
Woese et al. 19771 6 reinos
Woese et al. 19902 3 dominios
Eubacteria
Bacteria
Archaebacteria
Archaea
Monera
Protista Protista
Protista
Fungi
Fungi
Plantae
Plantae
Plantae
Animalia
Animalia
Animalia
Protista Eukaryota
Vegetalia Animalia
Plantae Animalia
Eukarya
Cronometros evolutivos 1. Molécula universalmente distribuida. 2. Moléculas funcionalmente homologas. 3. La molécula debe contener regiones conservadas y
regiones que permitan diferenciar organismos. 4. Hay que evaluar la velocidad de cambio de la molécula.
Citocromos, proteínas de Fe y S, RNAs ribosomicos.
Secuenciación de RNA ribosómico Técnica 16S
FILOGENIA vida
Árbol de la
Historia evolutiva de los organismos y relaciones entre ellos.
Teoría endo-simbiótica
Características comparativas de los 3 dominios
La evolución ha llevado un rumbo vertical ?
El anillo de la vida María C. Rivera James A. Lake 2004
Filogenia de Bacteria
Bacteria
Son procariotas, unicelulares. Sin membrana nuclear. No mitocondrias, no aparato de Golgi, no Retículo
Endoplásmico. Se reproducen de manera asexual. 1 – 20 um.
Filogenia de Archaea
Filogenia de Eucarya Se realizó por la subunidad 18s rRNA citoplasmático.
Protistas
Son unicelulares, flagelados y carecen de cloroplastos. Viven en ambiente anóxicos como el intestino de animales, se comportan como simbiontes o parásitos y toman la energía desde la fermentación.
Contienen dos núcleos de igual tamaño
Carecen de intrones, tienen cuerpo parabasal
Protistas
Son unicelulares, son parásitos u organismos de vida libre flagelados que se dividen en dos grupos.
Viven en el agua, se alimentan de bacterias, pueden ser patógenos. Kinetoplastidos
No patógenos, acuáticos, fototróficos con clorofila Euglenidos
Protistas
Se caracterizan por presentar una estructura de función desconocida llamada alveolo. Se cree que dicha estructura ayuda a mantener el balance osmótico de la célula. Se dividen en 3 grupos: ciliados, dinoflagelados y apicomplexas. •CILIADOS: cilios para movilidad y obtención de comida. Son los únicos que tienen micro y macro núcleo. Simbiontes o parásitos. •DINOFLAGELADOS: Son acuáticos, contienen dos flagelos con diferente forma y longitud. •APICOMPLEXA: Son parásitos obligados, cuyas formas
Protistas Ciliados Apicomplexa
Dinoflagelados
Protistas
Diatomeas: fototrofos unicelulares, componentes
principales del plankton. Contienen una pared celular compuesta de silica que le confiere a la célula formas muy variadas.
Protistas
Oomicetos: inicialmente agrupados como
hongos. Su ciclo de vida tiene una fase sexual y una asexual. Pared celular de celulosa. Algas doradas: unicelulares o pluricelulares,
pigmentadas, flageladas
Protistas
Terrestres o acuáticos utilizan pseudopodos para
moverse y comer. Incluyen los mohos del cieno y las amebas.
Hongos Tienen diferentes formas.
Su principal hábitat es la tierra. Muchos son parásitos de plantas. Algunos son patógenos para humanos y
animales. Se comportan benéficamente para el hombre en procesos como la fermentación.
Hongos Organismos eucariotas. Núcleo definido. Organelas, incluyendo pared celular. Existen en forma de hifas y levaduras y
macroscópicos.
Hifas
Levaduras
Setas
Hongos Árbol filogenético de los Hongos.
Hongos
Presentan movimiento por flagelo. Los de vida libre viven sobre materia animal o
vegetal en agua dulce, lodo o en el suelo. Tiene diferentes ciclos vitales que implican reproducción sexual y asexual. Son unicelulares.
Hongos
La mayoría viven sobre materia vegetal en
descomposición. Algunos son parásitos de plantas , insectos, animales y humanos.
Hongos
Tienen importancia en los hábitats de agua dulce,
marinos y terrestres, pues degradan compuestos orgánicos como la celulosa y el colágeno.
Hongos
Hongos de vida libre o patógenos para el humano
por infección o producción de toxinas.
Algas
Principalmente se encuentran en hábitats marinos, pero pocas especies pueden estar en agua dulce o tierra. Unicelulares y multicelulares.
Algas
Parásitos Eucariotas. Pluricelulares y unicelulares.
1um – 10m. Ciclos de vida complejos. Se pueden clasificar como endoparásitos o
ectoparásitos. Son evolucionados: sistema nervioso, digestivo, circulatorio, respiratorio y reproductor rudimentario. Factores importantes en la transmisión: contaminación fecal, educación, higiene y
Parásitos
Artrópodos Los artrópodos son animales invertebrados que tienen el cuerpo
cubierto por un caparazón articulado. Todos los artrópodos son animales ovíparos. Los artrópodos que viven en la tierra, respiran por tráqueas Los artrópodos que viven en el agua respiran por branquias. Hay diferentes grupos de artrópodos: insectos, arácnidos, crustáceos y miriápodos. INSECTOS
ARÁCNIDOS
Libélula
Escorpión
CRUSTÁCEOS
Carabinero
MIRIÁPODOS
Escolopendra
?
Virus Partículas infecciosas de menor tamaño.
Diametro 18 – 300 nm. Genoma DNA o RNA, no ambos a la vez. Lineal, circular o segmentado.
Cadena simple o cadena doble. No organelas. Su replicación depende de una célula
anfitriona.
Clasificación de los virus
Icosaédricos:
Cilíndricos o helicoidales:
Complejos: (ambos)
Concepto de especie ANIMALES Y PLANTAS
Población de individuos que pueden entrecruzarse en condiciones naturales, produciendo descendencia fértil, y que está aislada reproductivamente de otras poblaciones.
PROCARIOTAS
Es una especie diferente, aquel procariota cuya secuencia de RNA ribosómico 16s, difiera en más de un 3% de la del resto de los organismos.
Especiación bacteriana
NOMENCLATURA - Ej. Escherichia coli. Solamente hay un nombre correcto para un microorganismo. 2. Todos los nombres son escritos En Latín. 3. La primera palabra del género en Mayúscula y la de la especie en
minúscula, escribir en cursiva o subrayados. 4. Debe tener el respaldo de una Publicación y aparecer en International
Journal of Systematic Bacteriology (IJSB). 5. Cambio de un género a otro conserva especie. 6. Género sin indicar especie spp, si el género solo tiene 1 especie sp, si
hay subespecies ssp.
Ejemplo Dominio Phylum Clase
Orden Familia Género
Especie
Bacteria Gamma Proteobacteria Zymobacteria Chromatiales Chromatiaceae Allochromatium Allochromatium warmingii Bacteria roja del Azufre.
Colecciones de cultivos
Impacto de lo microorganismos sobre los humanos