Analisis Mikrobiologi Sampel Urin

ANALISIS MIKROBIOLOGI SAMPEL URIN

Oleh : Nama NIM Rombongan Kelompok Asisten

: Rahma Adilah : B1A015074 : II :7 : Arie Tri Pangestu Judanto

LAPORAN PRAKTIKUM BAKTERIOLOGI

KEMENTERIAN KEMENTERIAN RISET, TEKNOLOGI DAN PENDIDIKAN TINGGI UNIVERSITAS JENDERAL SOEDIRMAN FAKULTAS BIOLOGI PURWOKERTO 2017

I.

PENDAHULUAN

A. Latar belakang

Ekskresi merupakan proses pengeluaran zat sisa metabolisme baik berupa zat cair ataupun zat gas. Zat-zat sisa tersebut dapat berupa urine (ginjal), keringat (kulit), empedu (hati), dan CO2 (paru-paru). Zat-zat ini harus dikeluarkan dari dalam tubuh  jika tidak dikeluarkan dari dalam tubuh akan mengganggu proses yang ada di dalam tubuh bahkan meracuni tubuh (Pearce, 2006).

Sistem perkemihan atau biasa juga

disebut Urinary System  adalah suatu sistem kerjasama tubuh yang memiliki tujuan utama mempertahankan keseimbangan internal atau Homeostatis. Fungsi lainnya adalah untuk membuang produk-produk yang tidak dibutuhkan oleh tubuh dan  banyak fungsi lainnya yang akan dijelaskan kemudian. Susunan sistem perkemihan terdiri dari: a) dua ginjal (ren) yang menghasilkan urin, b) dua ureter yang membawa urin dari ginjal ke vesika urinaria (kandung kemih), c) satu vesika urinaria (VU), tempat urin dikumpulkan, dan d) satu urethra, urin dikeluarkan dari vesika urinaria (Wibowo, 2005). Urin terdiri atas air (96%) , urea (2%), dan sisanya 2% terdiri atas asam urat, kreatinin, amonium, natrium, kalium, klorida, pospat, sulfat, dan oksalat. Urin  berwarna kuning jernih karena adanya urobilin, suatu pigmen empedu yang diubah di usus, direabsorbsi, kemudian diekskresikan oleh ginjal. Berat jenis urin antara 1020 dan 1030, sedangakn pH urin sekitar 6 (rentang normal 4,5-8). Orang dewasa yang sehat mengeluarkan 1000-1500 ml urin per hari. Jumlah urin yang diasilkan dan  berat jenisnya tergantung pada asupan cairan dan jumlah larutan yang diekskresi. Produksi urin berkurang saat tidur dan latihan (Setiadi, 2007). Infeksi Saluran Kemih (ISK) adalah keadaan ditemukannya mikrorganisme di dalam urin dalam jumlah tertentu. Dalam keadaan normal, urin mengandung mikroorganisme, umumnya sekitar 100 bakteri/mL urin. Pasien didiagnosis infeksi saluran kemih bila urinnya mengandung lebih dari 100.000 bakteri/mL (Sondakh et al., 2016). Pada tahun 2007, di Amerika Serikat saja, ada sekitar 10,5 juta kunjungan untuk gejala ISK (merupakan 0,9% dari semua kunjungan rawat jalan) dan 2-3 juta kunjungan ke gawat darurat (Flores-Mireles et al., 2015). Infeksi Saluran Kemih (ISK) adalah invasi bakteri pada saluran kemih yang menyebabkan respon inflamasi disertai timbulnya gejala-gejala seperti: demam (suhu tubuh > 380C), urinary

urgency,  pollakisuria, perasaan panas pada daerah supra pubik, yang bukan disebabkan infeksi lain. Dalam keadaan normal, air kemih ti dak mengandung bakteri, virus ataupun mikroorganisme lain, sehingga air kemih di dalam sistem saluran kemih biasanya steril. Untuk menegakkan diagnosis ISK harus ditemukan bakteriuria  bermakna melalui biakan atau kultur (Endriani et al., 2009). Infeksi saluran kemih (ISK) merupakan masalah kesehatan umum yang dialami oleh jutaan orang tiap tahunnya termasuk di Indonesia (Yacob et al., 2011). Enterobacteriace (termasuk  Esch-richia coli) dan  Enterococcus faecalis merupakan agen penyebab yang mencakup >95% dari ISK. Di laboratorium klinik Mikrobiologi Universitas Indonesia pada tahun 2002 jenis kuman yang terbanyak ialah  Escherichia coli (19%) dan yang kedua ialah  Klebsiella pneumoniae (13%). Hasil penelitian pada tahun 2002 sampai 2003 didapatkan kuman yang terbanyak  Escherichia coli (14%), dengan kedua terbanyak  Acinetobacter calcoa-ceticus (8%) (Sumolang et al., 2013),  Escherichia coli  adalah salah satu bakteri Gram negatif yang paling banyak dipelajari dalam mikrobiologi. Spesies ini telah dikaitkan dengan infeksi intestinal dan ekstraintestinal pada manusia dan hewan . Galur E. coli yang termasuk golongan  patogen

dan

berdasarkan

 Enteropathogenic

E.

 Enterohemorrhagic E.

sifat

coli 

virulensi

(EPEC),

dan

mekanisme

 Enterotoxigenic

coli  (EHEC),  Enteroinvasive

E.

E.

kerjanya coli 

yaitu

(ETEC),

coli  (EIEC),

dan

 Enteroadherent E. coli  (EAEC). Bakteri penyebab ISK lain yang paling sering seperti  Enterococcus spp, Klebsiella, Enterobacter spp, Proteus spp, dan  Pseudomonas sp, selain

itu ditemukan Streptococcus

group B,

Neisseria

 gonorrhoeae dan Chlamydia sp  yang ditularkan melalui kontak seksual (Carreno, 2002). B. Tujuan

Tujuan dari praktikum ini adalah untuk mengetahui metode deteksi bacteriuria dan identifikasi mikroorganisme yang berasosiasi dengan saluran urin.

II.

MATERI DAN CARA KERJA

A. Materi

Alat yang digunakan yaitu tabung reaksi, cawan petri, pembakar spiritus, jarum ose, pipet steril 1 ml, dan inkubator. Bahan yang digunakan yaitu sampel urin, medium  Blood Agar ,  Phenol Red  Lactose Broth dan akuades. B. Cara Kerja 

Isolasi

Tiga tabung pengenceran dan tiga cawan petri berisi medium  Blood Agar  disiapkan. Sampel urin sebanyak 1 ml diambil sebanyak 1 ml menggunakan pipet steril kemudian dimasukkan ke dalam tabung reaksi yang berisi 9 ml akuades sebagai  pengenceran pertama dan pengenceran dilakukan hingga 10 -3.  Plating dilakukan  pada tiap pengenceran secara  spread plate  pada medium  Blood Agar, kemudian  biakkan diinkubasi 2x24 jam pada suhu 37ºC. Koloni bakteri dihitung secara TPC kemudian dicocokan dengan tabel berikut. Koloni bakteri dihitung secara TPC kemudian dicocokkan dengan tabel berikut:



Rata-rata Jumlah koloni <25

Perkiraan jumlah bakteri  per ml <25000

Negatif bacteriuria

25-50

25000-100000

Suspicious

>50

>100000

Positif bacteriuria

Diagnosis

Uji Duga

Sampel urin sebanyak 0,1 ml dimasukkan ke dalam tabung reaksi yang berisi  Phenol Red Lactose Broth, lalu sampel urin yang telah dimasukkan ke dalam tabung reaksi diinkubasi selama 2x24 jam pada suhu 37ºC. Hasil inkubasi diamati dengan interpretasi sebagai berikut: Kuning : E. coli dan Enterococcus Orange : Klebsiella, Staphylococcus, dan Streptococcus Merah-keunguan : Proteus dan Pseudomonas

III.

HASIL DAN PEMBAHASAN

Tabel 3.1 Hasil Perhitungan Koloni Bakteri secara TPC

Pengenceran

Rata-Rata Jumlah Koloni

Perkiraan Jumlah

Diagnosis

Bakteri/mL

10-1

189

189 x 10 2

Negative

10-2

143

143 x 10 3

Positive

10-3

204

204 x 10 4

Positive

Gambar 3.1 Hasil Isolasi Sampel Urin Pengenceran 10 -1

Hasil perhitungan koloni bakteri dari isolasi sampel urin pada pengenceran 10-1 yang dapat terhitung pada medium  Blood Agar   yang pertama adalah sebanyak 196 koloni sedangkan pada medium  Blood Agar   yang kedua sebanyak 182 koloni dengan rata-rata koloni bakteri dari kedua medium  Blood agar   adalah sebanyak 189 koloni. Setelah dilakukan perhitungan koloni secara TPC, didapatkan hasil jumlah  bakteri sebanyak 189 x 10 2 yang menunjukkan bahwa sampel urin didiagnosis negative bacteriuria. ISK dinyatakan apabila ditemukan bakteri di dalam urin, mikroorganisme yang paling sering menyebabkan ISK adalah jenis aerob. Pada saluran kemih yang normal tidak dihuni oleh bakteri aerob atau mikroba yang lain, karena itu urin dalam ginjal dan buli –   buli biasanya steril. Walaupun demikian uretra  bagian bawah terutama pada wanita dapat dihuni oleh bakteri yang jumlahnya makin kurang pada bagian yang mendekati kandung kemih (Kumala et al., 2009).

Gambar 3.2 Hasil Isolasi Sampel Urin Pengenceran 10 -2

Hasil perhitungan koloni bakteri dari isolasi sampel urin pada pengenceran 10-2 yang dapat terhitung pada medium  Blood Agar   yang pertama adalah sebanyak 158 koloni sedangkan pada medium  Blood Agar   yang kedua sebanyak 128 koloni dengan rata-rata koloni bakteri dari kedua medium blood agar   adalah sebanyak 143 koloni. Setelah dilakukan perhitungan koloni secara TPC, didapatkan hasil jumlah  bakteri sebanyak 143 x 10 3 yang menunjukkan bahwa sampel urin didiagnosis  positive bacteriuria. Mikroorganisme dapat masuk ke dalam saluran kemih melalui  penyebaran endogen yaitu kontak langsung dari tempat infeksi terdekat (ascending), hematogen, limfogen dan eksogen sebagai akibat pemakaian kateter (Inayati & Falah, 2014).

Gambar 3.3 Hasil Isolasi Sampel Urin Pengenceran 10 -3

Hasil perhitungan koloni bakteri dari isolasi sampel urin pada pengenceran 10-3 yang dapat terhitung pada medium  Blood Agar   yang pertama adalah sebanyak

128 koloni sedangkan pada medium  Blood Agar   yang kedua sebanyak 280 koloni dengan rata-rata koloni bakteri dari kedua medium  Blood Agar  adalah sebanyak 204 koloni. Setelah dilakukan perhitungan koloni secara TPC, didapatkan hasil jumlah  bakteri sebanyak 204 x 10 4 yang menunjukkan bahwa sampel urin didiagnosis  positive bacteriuria. Mikroorganisme yang paling sering menyebabkan ISK adalah mikroorganisme gram negatif seperti  Eschericia coli, Proteus mirabilis, Klebsiela, Citrobacter, Enterobacter dan Pseudomonas.  Penyebab utama ISK (sekitar 85%) adalah bakteri  Eschericia coli. Mikroorganisme gram positif seperti  Enterococcus  faecalis, Staphylococcus saprophyticus  dan group B Streptococci dapat juga menyebabkan ISK. Chlamydia dan Mycoplasma juga diketahui dapat menyebabkan ISK yang sering ditularkan secara seksual (Prabowo & Habib, 2012).

Gambar 3.4 Hasil Uji Duga

Interpretasi hasil dari uji duga adalah warna kuning menunjukkan sampel terinfeksi bakteri  E. coli dan Enterococcus, warna orange menunjukkan sampel terinfeksi bakteri Klebsiella, Staphylococcus, dan Streptococcus, sementara warna merah keungunan menunjukkan sampel terinfeksi bakteri Proteus dan Pseudomonas. Hasil yang diperoleh dari kelompok 7 rombongan II menunjukkan hasil yang negatif karena tidak ada perubahan warna pada sampel, berarti sampel tidak terkontaminasi oleh bakteri. Pada umumnya penyebab utama ISK adalah Escherecia coli. Bakteri ini ditemukan secara luas pada penderita ISK , jumlahnya mencapai 50- 90 % (Pranoto et al., 2012).

IV.

KESIMPULAN DAN SARAN

A. Kesimpulan

Berdasarkan praktikum dan hasil pengamatan acara analisis mikrobiologi sampel urin, dapat disimpulkan bahwa dalam mendeteksi keberadaan bacteriuria di dalam sampel urin secara mikrobiologi dapat dilakukan melalui 2 uji yaitu isolasi dan uji duga. Hasil isolasi sampel urin yang didapatkan dari ketiga pengenceran (10 1

, 10

-2

, 10

-3

) menunjukkan hasil yang negatif dan positif terinfeksi bacteriuria.

Perbedaan yang cukup jauh dari hasil ketiga pengenceran dapat disebabkan oleh  beberapa faktor yaitu kurangnya keaseptisan. Sementara hasil yang didapatkan dari uji duga menunjukkan hasil yang negatif yang berarti sampel urin tidak terinfeksi oleh bakteri. Hal ini dapat disebabkan oleh kualitas media yang kurang baik sehingga tidak ada perubahan yang terjadi. B. Saran

Saran untuk praktikum acara analisis mikrobiologi sampel urin adalah diharapkan praktikan dapat bekerja secara lebih aseptis agar hasil yang didapatkan sesuai dengan yang diinginkan dan tidak terjadi kontaminasi oleh bakteri lainnya.

DAFTAR REFERENSI

Carreno, C. A., Funai E. F. 2002. Urinary Tract Infection in Pregnancy.  Journal Up to Date, 10(2): pp. 1-2. Endriani, R., Andrini, F & Alfina, D. 2009. Bakteri Penyebab Infeksi Saluran Kemih (ISK) di Pekanbaru. Jurnal Ilmu Kesehatan, 3(2): pp. 139-143. Flores-Mireles, A. L., Walker, J. N., Caparon, M & Hultgren, S. J. 2015. Urinary Tract Infections: Epidemiology, Mechanisms of Infection and Treatment   Option. Nature Reviews Microbiology, 13(2): pp. 1-16. Inayati & Falah, K. 2014. Uji Diagnostik Urinalisis Lekosit Esterase terhadap Kultur  Urin pada Pasien Infeksi Saluran Kemih (ISK) dengan Kateterisasi Uretra.  Jurnal Kedokteran Syifa Medika,4(2), pp. 100-108 Kumala, S., Raisa, N., Rahayu, L & Kiranasari, A. 2009. Uji Kepekaan Bakteri yang Diisolasi dari Urin Penderita Infeksi Saluran Kemih (ISK) terhadap Beberapa Antibiotika pada Periode Maret-Juni 2008. Majalah Ilmu Kefarmasian, 6(2): pp. 45-55. Pearce, E. C. 2006.  Anatomi Dan Fisiologi Untuk Paramedis. Jakarta: Gramedia Pustaka Utama. Prabowo, F. I & Habib, I. 2012. Identifikasi Pola Kepekaan dan Jenis Bakteri pada Pasien Infeksi Saluran Kemih di Rumah Sakit PKU Muhammadiyah   Yogyakarta. Jurnal Mutiara Medika, 12(2): pp. 93-101. Pranoto, E., Kusumawati, A & Hapsari, I. 2012. Infeksi Saluran Kemih di Instalasi Rawat Inap RSUD Banyumas Periode Agustus 2009-Juli 2010.  Jurnal    Pharmacy, 9(2), pp. 9-18. Setiadi. 2007. Anatomi & Fisiologi manusia. Yogyakarta : Graha Ilmu

Sondakh, F. A., Fatimawali & Wewengkang, D. S. 2016. Uji Kepekaan Bakteri yang Diisolasi dan Diidentifikasi dari Urin Penderita Infeksi Saluran Kemih di RSUP Prof. Dr. R. D. Kandou Manado Terhadap Antibiotik Amoksisilin, Gentamisin dan Seftriakson. Jurnal Ilmiah Farmasi, 5(4): pp. 123-129. Sumolang, S. A. C., Porotu’o, J & Soeliongan, S. Pola Bakteri pada Penderita Infeksi Saluran Kemih di Blu RSUP Prof. dr. R. D. Kandou Manado.  Journal e Biomedik (EBM), 1(1): pp. 597-601. Wibowo, D. S. 2005.  Anatomi Tubuh Manusia. Jakarta: Gramedia Widiasaran   Indonesia. Yacob, T., Endriani, R., Hamidy, M. Y & Budiman, M. A. 2011. Resistensi Antibakteri pada Pasien Infeksi Saluran Kemih (ISK) dengan Kateterisasi Urin di Bagian Penyakit Dalam RSUD Arifin Achmad   Pekanbaru. Jurnal Ilmu Kesehatan, 5(2): pp. 94-100.