Bergeys Manual of Determinative Bacteriology
El Manual de David Bergey´s, Bergey´s, catedrático de bacteriología, publico este manual hablando sobre las características características de las bacterias de interés médico y ha ido actualizándose a lo largo de los años. Este manual manual está enfocado más a la clasificación que a la identificación de las bacterias. Se basa mayormente en la tinción de Gram, así agrupa a todas las bacterias en un solo reino como son: las procariotas y estas a su vez se subdividen en cuatro: las Gracilicute Gracil icutes, s, Fi Firmicutes, Ten Tenericu ricutes y Men Mendosicu icutes.
También se habla sobre la base de caracteres descriptivos morfológicos para las bacterias como son: espiroquetas, cocos, bacilos aerobios gramnegativos y cocos grampositivas, etc. Y suscaracterísticas morfológicas microscópicas de las colonias y pigmentación, condiciones de crecimiento y nutrición, fisiología y metabolismo, características genéticas, plásmidos y bacteriófagos, estructura antigénica, patogenicidad y ecología. En cuanto a la taxonomía este manual es usado para la identificación de bacterias como microorganismos la cual proporciona una tabla de características que diferencian procariotas de eucariotas también proporcionan claves indicando las características que pueden ser usadas para diferenciar los géneros dentro del grupo. Dado que de esta forma las bacterias pueden dividirse en cuatro grandes categorías las cuales citaremos I. Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular II. Eubacterias Gram-positivas que tienen pared celular III. Eubacterias carentes de pared celular IV. Arqueobacterias De igual manera menciona que el procedimiento de identificación puede ser difícil de determinar en cuanto a su género, a que grupo pertenece y a los valores de emologia del ADN por esto se usan sistemas de clasificación bacteriana. CATEGORIA I - Eubacterias Gram-negativas que tienen pared celular; Grupos 1-16. Grupo 1 – 1 – ESIROQUETAS
El cuerpo es helicoidal y flexible, entrelazado con el filamento axial (por encima de la capa de mureína). Dentro de esta estructura está el cilindro protoplásmico (cuerpo de la bacteria) y la membrana externa. El filamento axial tiene la estructura de un flagelo, y también se llama endoflagelo. Se encuentran fijados en los extremos de las espiroquetas, existiendo end oflagelos en ambos lados de la bacteria. La longitud de los endoflagelos es 2/3 de la longitud de la bacteria. Pueden existir desde dos a cientos. Debido a su tamaño, existe una zona donde se superponen los endoflagelos. Los endoflagelos tienen mucho que ver con la movilidad que es muy peculiar, puede ser por: flexión, latigazo y por guía geométrica. Se mueven mucho mejor a viscosidades elevadas: tactismo positivo para viscosidades elevadas, por lo que se mueven mejor en lugares como lodos o mucosas animales. Los flagelos f lagelos se mueven por rotación, como una hélice, por lo que gira la envuelta de la bacteria y si hay rozamiento (por la elevada viscosidad) se frena la envuelta y la bacteria avanza. Genero Borrelia
Especie burgdorferi
Genero Leptospira
Especie biflexa
Grupo 2 – BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS AERÓBICAS O MICROAERÓFILAS, MÓVILES,
HELICOIDALES O VIBRIOIDES. Bacterias Gram Negativas Móviles Helicoidales o Vibrioides, Aerobias o Microaerófilas. Células Gram negativas, móviles por flagelación polar. Metabolismo respiratorio con oxígeno como aceptor de electrones, algunas pueden realizar respiración anaerobia. Quimiorganotróficas, aunque algunas pueden crecer auxotróficamente con hidrógeno (H2) como dador de electrones. Habitan en el suelo, aguas dulces y marinas, en raíces de plantas u órganos reproductivos, tracto intestinal y cavidad oral del hombre y animales. Algunas especies son patógenas del hombre y animales, otros son predadores de otros microorganismos . Genero Alteromonas
Especie hispanica
Genero Herbaspirillum
Especie chlorophenolicum
Grupo 3 - BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS CURVADAS NO MÓVILES O RARAMENTE
MÓVILES. Bacilos curvados, en forma de "S" o helicoidales, gram negativos, generalmente inmóviles. Algunas especies forman vesículas de gas. Quimio organotróficos, habitan en el suelo agua dulce y marino. Genero Ancylobacter
Especie aquaticus
Genero Meniscus
Especie Tear
Genero Runella
Especie vulgaris
Grupo 4 - COCOS Y BACILOS GRAM-NEGATIVOS AERÓBICOS O MICROAERÓFILOS
Grupo de bacterias gram negativas constituidas por células en forma de bastones o cocos. Son aerobias (capaces de crecer bajo el aire atmosférico) y microaerofílicas (crecen mejor con bajas concentraciones de oxígeno) bajo condiciones con nitrógeno fijo pero, cuando se les suministra una fuente fija de nitrógeno crecen como aerobias. Subgrupo 4A Genero Acetobacter
Subgrupo 4B Genero Bacteroides
Especie xilinum
Genero Erythrobacter
Especie melaninugenicus
Genero Taylorella
Especie Pylori
Especie equigenitalis
Genero Oligella
Genero Wolinella
Especie ureolytica
Especie recta
Grupo 5 - BACILOS GRAM-NEGATIVOS ANAEROBICOS FACULTATIVOS.
Gran grupo de bacterias facultativas anaerobias, en forma de bastoncillo que muestran un color rosado (negativo) cuando se tratan con el m étodo de coloración de gram. Subgrupo 1 - Familia Enterobacteriaceae Genero Especie Genero
Especie
Genero
Especie
Arsenophonus
nasonia
Hafnia
Alvei
Subgrupo 2 – Familia Vibrionaceae Genero Especie Genero Aeromonas veronii Photobacterium
Subgrupo 3 – Pasteurellaceae Genero Especie Actinobacillus suis
Genero Haemophilus
Especie Damselae
Especie Influenzae
GRAM-NEGATIVAS, ANAEROBIOS, HELICOIDALES. Grupo
Proteus
6.
mirabilis
Genero Vibrio
Especie cholerae
Genero Pasteurella
Especie multocida
BACTERIAS RECTAS, CURVAS Y
Este grupo corresponde de manera muy amplia a los organismos asignar a la familia Bacteroidaceae en el manual de Berge y de Bacteriología sistemática. El grupo se ha vuelto tan diversas que esencialmente todo lo que ahora tienen en común es que han sido considerados como anaerobios y que dan tinción de Gram negativo, de hecho, no son todos los anaerobios, algunos es decir, especies Wolinella, Bacteroides gracilis, y Ureolyticus bacteroides, ahora han demostrado ser microaerófilos, capaces de respirar con oxígeno, sin embargo, se incluyen aquí por conveniencia. Genero Cellulolyticus
Especie acetivibrio.
Genero Acetogenium
Especie kivui
Grupo 7: SULFATO-O DISSIMILATORY BACTERIAS REDUCTORAS DE AZUFRE.
Células son esférico, ovoide en forma de barra, en espiral ; 0,4-3,0 µm de diámetro, que ocurre aisladamente, en parejas, o en ocasiones en los agregados. Genero Desulfotomaculum
Especie nigrifican
Genero Desulfomonas
Especie pigra
Grupo 8: ANAEROBIA GRAM-NEGATIVA COCOS.
Cocos, su diámetro es de 0.3 – 0.5 – 2.5 µm, se producen característicamente en pares. Gram negativas, pero las células tienden a resistir la decoloración. No son móviles, no se producen flajelos. Anaeróbica y oxidasa negativa. Cepas de catalaza negativo, pero se descompone peroxidasa por una pseudocatalaza.
Genero Acidaminococcus
Especie fermentans
Genero Syntrophococcus
Especie sucromutans
GRUPO 9: EL RICKETTSIAS Y CLAMIDIAS.
Se subdivide en dos grupos. Este subgrupo se multiplica por fisión binaria, no por un complejo cic lo de desarrollo. son principalmente las bacterias en forma de varilla, cocoide, y pleomórfico. puede haber excepciones para cada una de estas características. no móviles, obligadamente parásitos, bacterias cocoides que se multiplican sólo dentro de vacualas con membrana delimitadas en el citoplasma de las células de seres humanos, otros mamíferos y aves.
Rickettsias.
Clamidias.
GRUPO 10 - BACTERIAS ANOXIGÉNICAS FOTOTRÓFICAS.
Células son espiral esférica, o de varilla de vibrio - formada y son 0.3 – 6.0 µm de diámetro. Que se producen solos o en agregados regulares o irregulares; formas filamentosas unicelulares o multicelulares también ocurren. Gram negativo. En la mayoría de los casos, la multiplicación es por fisión binaria: algunas especies se multiplican por gemación. Genero Amoebobacter
Especie roseus
Genero Chromatitum
Especie okenni
Grupo 11 - BACTERIA OXIGONIAS FOTOTRÓFICAS
Las cianobacterias: comprenden a las bacterias que son capaces de realizar fotosíntesis oxigénica y a los plastos, también se les denomina oxifotobacterias. La clasificación de las cianobacterias: Sistema de clasificación de cianobacterias: se clasifican sistemáticamente yen ordenes (de acuerdo a su morfología). Subgrupo 1 (orden: Crococales) unicelulares o coloniales, con pocas células grupo heterogéneo. Genero Cyanothece
Especie SP
Genero Cloeocapasa
Especie SP
Genero Microcystis
Especie SP
Grupo 12 - BACTERIAS AEROBIAS QUIMIOLITOTRÓFICAS Y ORGANISMOS ASOCIADOS
Subgrupo 1-bacterias incoloras sulfuro-oxidantes. Grupo 13 - OTROS INCIPIENTES O BACTERIAS APPENDAGED. Subgrupo 1-Prosthecate bacteria Genero Especie Genero
Especie
Genero
Especie
Dichotomicrobium
SP
Caulobacter
SP
SP
Ancalomicrobium
Grupo 14 - BACTERIAS ENVAINADAS.
Genero “Clonothrix”
Especie SP
Genero Crenothrix
Especie SP
Genero “Phragmidiothrix”
Especie SP
Grupo 15 - NO FOTOSINTÉTICAS, DESPLAZAMIENTO BACTERIAS.
Subgrupo 1-bateo sencillo célula, en forma de barra de deslizamiento bacterias Genero
Thermonema
Especie SP
Genero
Cytophaga
Especie SP
Genero
Chitinophaga
Especie SP
Grupo 16 - BACTERIAS DESLIZANTES FRUTESCENTES: MICOBACTERIAS
Quimioorganotrofas, las bacterias aeróbicas que no tienen estrictamente flagelos pero pueden deslizarse por superficies sólidas. Bajo condiciones de privación de nutrientes, agregado de células para formar cuerpos fructíferos compuestos de limo modificado y células, que son a menudo de colores brillantes y de dimensiones macroscópicas. Los cuerpos fructíferos varían en complejidad, de los montones simples a estructuras complejas que consisten de esporangios de forma característica y dimensiones, cosa que puede ser sésil o nacen solas o en grupos en tallos simples o ramificados. Dentro de los cuerpos fructíferos, las células se convierten en células en reposo o bien llamados microesporas o micro quistes.
Género Angiococccus
A. disciformes
Categoría II - Eubacterias gram positivas que tienen pared celular. Grupo 17 - COCOS GRAM POSITIVOS:
Quimioorganotrofas, mesófita, no formador de esporas tres grandes subdivisiones pueden ser reconocidos: i. Cocos aeróbicos que se producen en racimos, parejas o tétradas. Catalasa positivo. Los citocromos presente. Ácidos teicoicos no presentes en las paredes celulares. Producciones de ácido de los carbohidratos a menudo puede ser negativo o débil. ii. Cocos anaerobios facultativos o microaerofílico que ocurren en pares, cadenas de racimo, o tétradas. La presencia de catalasa, citocromos, y de células de pared ácidos teicoicos varía. Citocromos puede o no estar presente. iii. Cocos anaerobios estrictos que se presentan en pares. Las cadenas, tétradas o paquetes cúbicas. Los citocromos están ausentes en los géneros que han sido probados. La reacción de la catalasa es generalmente negativa, aunque en algunos casos se produce una reacción débil o pseudocatalasa.
Género Aerococcus Género Coprococcus
A. viridans C. eutactus
Grupo 18 - COCOS Y BACILOS GRAM-POSITIVOS FORMADORES DE ESPORAS.
Bacterias que producen endosporas resistentes al calor. Endosporas están mejor verificada por pruebas de que los cultivos de sobrevivir a una temperatura de 70-80 º C durante 10 min, seguido por el cultivo en condiciones adecuadas. Varillas o filamentos móviles en su mayoría, sin embargo, un género contiene móviles cocos (en tétradas o paquetes cúbicas). Más tinción de Gram positiva, al menos en cultivos jóvenes: sin embargo, uno manchas género Gram negativo. Aerobios
estrictos, anaerobios facultativos, microaerófilos o anaerobios estrictos. Un género anaeróbico respira anaeróbicamente con sulfato.
Género Amphibacillus Género Bacillus Género Clostridium Grupo
A. xylanus B. subtilis C. butyricum
19 - BACILOS GRAM –POSITIVOS NO FORMADORES DE ESPORAS CON
MORFOLOGÍA REGULAR. En forma de varilla (células cocoides a las barras alargadas o filamentos), Gram positivos, esporas no pigmentada (un género tiene una ligera pigmentación amarilla), quimioorganotrofas mesófilos, y sólo crecen en medios complejos. Algunos son patógenos de animales. Tres subdivisiones principales fisiológicas pueden ser reconocidas. i. microaerófilos fermentativos, sacarolíticas que no poseen contienen hemocatalasa, citocromos, o menaquinonas y que utilizan oxigeno sólo a través de flavina contienen oxidasas y peroxidasas. ii. aerobios o anaerobios facultativos que poseen cofactores y enzimas para la respiración. Estos organismos también son capaces de fermentar los azúcares, principalmente a ácido láctico, bajo condiciones oxígeno limitados o anaeróbica. iii. aerobios estrictos que no utilizan glucosa como fuente de carbono o energía, ni fermentan azúcares para ácido orgánico.
Género Brochothrix Género Carnobacterium
B. thermosphacta D. divergens
Grupo 20 - BACILOS GRAM POSITIVOS NO FORMADORES DE ESPORAS CON MORFOLOGÍA
IRREGULAR. La mayoría son barras irregulares que tinción de Gram positivo, crecer en presencia de aire, y no produce endosporas. Algunas pueden presentarse en forma de club de formularios, elementos filamentosos ramificados o mezclas de barras o formas filamentosas y cocoides, y algunos pueden tener un ciclo de varilla. Requerimientos de oxígeno van desde lo estrictamente aeróbico o anaeróbico facultativo a microfílico o anaeróbico estricto. Algunos son patógenos de animales o plantas.
Género Acetogenium Género Actinomyces
A. kivui A. bovis
Grupo 21 - MYCOBACTERIAS
Descripción: Estas son delgadas, en forma de barra, característicamente acido alcohol resistentes, aeróbicas, de crecimiento lento, y de vida libre o patogenas de vertebrados, ligeramente GramPositiva, no esporulados. Principales diferencias: ácido-alcohol resistente, crecimiento. Genero
Especie
Mycobacterium
Tuberculosis
Grupo 22 - ACTINOMYCETOS NOCARDIOFORMES
Descripción: Se trata de un grupo heterogéneo, muchos de los cuales forman filamentos que se fragmentan en elementos más cortos. Las antenas que crecen están formadas por algunos géneros y pueden producir cadenas de esporas. Géneros se distinguen principalmente por la pared quimiotípica, la presencia o ausencia de ácidos micólicos y otros caracteres químicos. Subgrupos
Subgrupo 1 Bacterias que contienen ácido micólico
Gordona bronchialis Subgrupo 2 Pseudonocardia y géneros relacionados
Actinobispora yunnanensis Subgrupo 3 Nocardioides y Terrabacter
Nocardioides albus Subgrupo 4 Promicromonosora y géneros relacionados
Jonesia denitrificans
Grupo 23 -
GÉNEROS CON ESPORANGIO MULTILOCULAR
Descripción: Estos géneros forman filamentos que dividen por los tabiques longitudinales y transversales. Esto produce gran cantidad de elementos de tipo cocoide, que pueden ser móviles (Dermatophilus, Geodermatpophilus) O no móviles (Frankia). Genero
Especie
Frankia
alni
Grupo 24 - ACTINOPLANETOS
Descripción: Se forman filamentos estables, con poco o ningún crecimiento aéreo. Esporas móviles se producen en esporangios y esporas inmóviles se producen por sí solos o en cadenas. La pared celular contiene meso-DAP y glicina, y arabinose y xilosa encontrado en células enteras hidrolizadas. Genero
Especie
Actinoplanes
philippinensis
Grupo 25 - STREPTOMYCETOS Y GÉNEROS RELACIONADOS
Descripción: Un grupo heterogéneo, todas ellas con paredes celulares que contienen r-DAP y glicina. Filamentos estables se forman y pueden producir crecimiento aéreo extenso con cadenas de esporas largo. Otros géneros producen pequeñas o no crecimiento aéreo y tienen una variedad en la forma de las esporas . Genero
Especie
Intrasporangium
calvum
Grupo 26 – MADUROMYCETOS
Descripción: Filamentos estables se forman y producen cantidades variables de crecimiento aéreo, quienes llevan esporas. Cadenas cortas de arthrospores inmóviles son producidas por Microbispora (dos esporas), Microtetraspora (cuatro esporas), y Actinomadura (numero variable). Otros géneros producen esporas en esporangios que se mueven (Planobispora, Planomonospora, Spirillospora) o son inmoviles (Strrptosporangium). La pared cellular contiene meso-DAP, y las celulas hidrolizadas contienen madurosa. Subgrupo 1 Streptosporangium y géneros relacionados
Microbispora rosea Subgrupo 2 Actinomadura Actinomadura madurae
Grupo 27 - THERMOMONOSPORA Y GÉNEROS RELACIONADOS
Descripción: Filamentos estables se forman y producen crecimiento aéreo con esporas que están solas (Thermomonospora), en cadenas ( Actinosynnema, Nocardiopsis), o en estructuras similares a esporangios (Streptoalloteichus). La pared celular contiene meso-DAP, pero no los característicos aminoácidos o azucares en la pared celular de células hidrolisadas. Ejemplo: Genero
Especie
Nocardiopsis
dassonvillei
Grupo 28 THERMOACTINOMYCETES.
Actinomicetos tienen capacidad de producir los antibióticos y son bacterias Grampositivas que comprenden un grupo de ramificación microorganismos unicelulares. Género
Especie
Género
Especie
Thermoactinomyces
sacchari
Thermoactinomyces
vulgaris
GRUPO 29 - OTROS GÉNEROS.
La principal característica de los actinomicetales es su capacidad para formar filamentos delgados ramificados o un micelio ramificado similar a los hongos (aunque de m enor diámetro). Además, al igual que los hongos, producen esporas. Son bacterias Gram positivas (que tienen en su pared celular peptidoglicano), resistentes a la penicilina, lo que constituye la principal diferencia con los hongos filamentosos. La mayoría son seres aerobios estrictos, que crecen bien a temperaturas del orden de los 25ºC, son por tanto, microorganismos mesófilos; y a pH alcalino (pH ≈ 9).
Género
Especie
Género
Especie
Glycomyces
halotolerans
Saccharothrix
australiensis
Categoría III - (Eubacterias carentes de pared celular: Mycoplasmas o Mollicutes); Grupo 30. Grupo 30 - MICOPLASMAS.
Procariotas más pequeñas y simples que se replican por sí mismos (bipartición). Son inmóviles, carentes de esporas, aerobios Gram negativos. Tienen una celular rígida (pleomorfismo) y están limitados por una membrana plásmatica (triple). Pertenecen a la clase Mollicutes (mollis: blando, cutis: piel) y tienen Limitadas opciones metabólicas para la replicación y supervivencia (pequeños genomas). Son resistentes a la penicilina, pero son muy sensibles a las tetraciclinas. Género
Especie
Género
Especie
Acholeplasma
axanthum
Mycoplasma
hyosynoviae
Categoría IV (Archaeobacteria); Grupos 31-35 Grupo 31 - METANÓGENAS.
Son microorganismos procariontes que viven en medios estrictamente anaerobios y que obtienen energía mediante la producción de gas natural, el metano (CH 4). Gracias a esta característica, este tipo de organismo tiene una gran importancia ecológica, ya que interviene en la degradación de la materia orgánica en la naturaleza, y en el ciclo del carbono. Las metanógenas son un grupo filogenéticamente heterogéneo en donde el factor común que las une es la producción de gas metano y sus cofactores únicos. Subgrupo 1
Género
Especie
Género
Especie
Methanobacterium
ruminantium
Methanosphaera
stadtmanae
GRUPO 32 - REDUCTORES ARCAICOS DE SULFATO.
Es una archaea reductora del sulfato (a sulfuro), acoplando esta reducción a la oxidación de diversas fuentes orgánicas de carbono, incluyendo polímeros complejos. También puede vivir quimiolitoautotróficamente uniendo la oxidación de tiosulfato a la reducción del gas hidrógeno.
Género
Especie
Género
Especie
Archaeoglobus
fulgidus
Archaeoglobus
profundus
GRUPO 33 - ARQUEOBACTERIAS EXTREMADAMENTE HALÓFILAS (HALOBACTERIAS).
Son un grupo diverso de microorganismos que habitan en ambientes salinos donde la concentración es muy alta (hasta 5 molar o 25% de NaCl). Estos procariotas requieren la sal para el crecimiento, sus paredes celulares, ribosomas y enzimas, se estabilizan con el ión Na +. Las arqueobacterias halófilas pueden obtener energía a partir de la luz mediante un proceso que no es la fotosíntesis. Cuando baja la tensión de oxígeno al evaporarse el agua la bacteria exporta a la membrana celular una proteína llamada bacteriorrodopsina que lleva unido un grupo cromóforo carotenoido: el retinal que es de color púrpura. Género
Especie
Género
Especie
Haloarcula
marismortui
Haloferax
alexandrinus
GRUPO 34 - ARQUEOBACTERIAS CON MENOR PARED CELULAR.
Anaerobio facultativo que respira azufre y carbono orgánico. No tiene pared celular, pero en vez de ello dispone de una membrana única compuesta principalmente de un lipoglicano tetra-eter que contiene un lípido tetra-eter unido a un oligosacárido que contiene glucosa y manosa. Género
Especie
Género
Especie
Thermoplasma
acidophilum
Thermoplasma
volcanium
GRUPO 35 - METABOLIZADORES DE AZUFRE EXTREMADAMENTE TERMÓFILOS E
HIPERTERMÓFILOS. Obligadamente termófila (Temperatura óptima de crecimiento entre 70-100 °C). Por lo general son anaerobios estrictos pero también pueden ser aeróbicos o facultativos; acidófilas o neutrofílica; autotrófico o heterótrofos. La mayoría son metabolizadores de azufre. S0 se puede reducir a H2S anaeróbicamente; H2S o S0 oxida a H2SO4 aeróbicamente. Subgrupo 1 Género
Especie
Género
Especie
Acidianus
convivator
Metallosphaera
hakonensis