CARACTERISTICAS DE LAS BACTERIAS Y SU LOCALIZACION 1. Flora microbiana en la salud y en la enfermedad.
Tradicionalmente, los microbiólogos clínicos tienen como tarea la de aislar e identificar los microorganismos microorganismos de las muestras de pacientes que sufren una enfermedad infecciosa. Por definición, esos microorganimos son denominados patógenos, es decir causantes de enfermedades (infecciosas). (infecciosas). Sin embargo, este punto de visto puede sugerir, equivocadamente, que unicamente un pequeño numero de microorganismos son capaces de provocar enfermedades, independientemente independientemente de su sitio de entrada en el paciente, de su cantidad, del estado o tipo del paciente, y de la posible presencia de otros microorganismos. Pero sobretodo, este tipo de actitud, ace recaer equivocadamente, e!clusivamente sobre el microorganismo, el desarrollo desarrollo o no de una enfermedad infecciosa. Sin embargo, la enfermedad infecciosa debe entenderse como sólo una de las posibles consecuencias de la interacción entre microorganismos y u"spedes. #n realidad, e!isten pocos microorganismos capaces de provocar una enfermedad infecciosa en cualquier tipo de u"sped y en cualquier situación. $dem%s, nuestro organismo est% desde su nacimiento no sólo en contacto con un ambiente rico en microorganismos, microorganismos, sino poblado o coloni&ado por un n'mero de c"lulas de microorganimos superior al de nuestras propias c"lulas. a mayoría pues de microorganismos est%n en nuestro propio cuerpo y no representan para el individuo sano normal un peligro para su salud. $l contrario, los microorganismos est%n en equilibrio con el resto de nuestro organismo, y la ruptura de ese equilibrio puede provocar el desarrollo de enfermedades infecciosas. #emplos de esos procesos podrían ser los problemas intestinales que se suceden tras la eliminación de flora bacteriana intestinal por el uso inadecuado de antibióticos, o la alteración de flora vaginal por una adecuada igiene o por tampones inadecuados, con la siguiente suplantación de Lactobacillus y otra flora normal por otros microorganismos patógenos (por eemplo Staphylococcus Staphylococcus aureus productores de to!inas). *. +abe&a y tracto respiratorio reas generalmente est"riles. #stas %reas son la laringe, tr%quea, bronquios, bronquiolos, bronquiolos, y alv"olos pulmonares. #s bastante frecuente frecuente la contaminación ocasional por microorganismos, sin embargo, los varios mecanismos de defensa e!istente en esos lugares (principalmente los movimientos ciliares y la mucosidad) se encargan de eliminarlos rapidamente. a muestra de tracto respiratorio m%s remitida al laboratorio es el esputo, seguidos por los lavados bronquiales y broncoalveolares, esp"cimenes broncoscópicos, broncoscópicos, fluídos toracent"sicos, y aspirados de traqueotomías y de lesiones pulmonares. os esputos y la mayoría de
los dem%s tipos de muestras suelen estar contaminados por la flora indígena de garganta, nari& y boca, por lo que se aconsea su r%pido procesamiento para evitar que la posible flora patógena quede disminuida por el sobrecrecimiento de esa flora indígena. a flora mayoritaria de los esputos son los estreptococos, Enterobacteriaceae, Moraxella catharralis, Pseudomonas aeruginosa y Candida albicans.
as bronquitis (infecciones bronquiales agudas), que se observan mayoritariamente en niños y personas mayores al comien&o del invierno, suelen estar asociadas a infecciones por Staphylococcus aureus , Streptococcus pneumoniae, Streptoccus pyogenes, Haemophilus influenzae, y Miycoplasma pneumoniae, y Bordetella pertussis en el caso de que aya tosferina. os abscesos pulmonares suelen estar causados por pneumonías debidas a S. aureus y . pneumoniae. Tambi"n, por microorganismos aspirados a partir de la flora nasofaríngea, y en ese caso predominan Bacteroides! Pre"otella! Porphyromonas y #usobacterium. as lesiones de este tipo deben incluir siempre una tinción %cido-alcool resistente para buscar ese tipo de organismos, así como la b'squeda de ongos. reas que generalmente no est%n est"riles.
oca.
#n la boca se deben considerar la cavidad bucal, dientes, lengua, paladar y saliva. #n esta región solemos encontrar S. aureus y S. epidermidis, así como sus variantes anaeróbicas. /arias especies de Streptococcus, particularmente S. sali"arius y S! mitis, est%n ampliamente repartidas por toda la boca, con predominancia de algunas esopecies particulares en determinados sitios concretos. #n la saliva suele ser com'n las cepas pigmentadas de especies de $eisseria, Moraxella ( Branhamanella% catharralis, &eillonella,
corinebacterias aeróbicas, etc. 0gualmente, podemos encontrar especies de enterobacterias como E. coli y . pneumoniae en la saliva. 1inalmente, en los dientes abundan especies bacterianas anaeróbicas. #n los casos de enfermedades de estos sitios, podremos encontrar una variedad todavía mayor de microorganismos, entre ellos los ongos filamentosos o no(p.e. en pacientes debilitados o con
quimioterapia), asi como virus.
2arganta (incluyendo nasofaringe, orofaringe y amígdalas).
os micrococos son qui&%s los m%s representativos. S. aureus se aisla frecuentemente de nasofaringe y amígdalas. as amígdalas pueden albergar estreptococos y enterococos. #n la garganta adulta normal podemos encontrar especies de $eisseria (incluyendo $. meningitidis% y Streptococcus pneumoniae sin necesidad de correlacionar su presencia con enfermedad alguna. as enfermedades infecciosas de la garganta pueden estar causadas por mucos microorganismos. #n algunos casos, estas infecciones comien&an por virus para rapidamente ser suplantados por bacterias y ongos. #n mucos países Streptococcus pyogenes es el agente causal m%s importante, y su detección debe seguirse con terapia antimicrobiana para evitar sus posibles secuelas (fiebres reum%ticas postestreptocócicas). Sin embargo, el alla&go de Streptoccus pneumonie (pneumococos) debe tomarse como parte de la flora normal de los adultos. #l papel de S. aureus es m%s controvertido ya que se encuentra en pequeño n'mero en la garganta normal, aunque su aislamiento repetido y en n'mero elevado puede sugerir que se trata del agente causal. as infecciones por Candida suelen asociarse a regímenes quimioter%picos, a pacientes inmunocomprometidos, debilitados, o neonatos. as faringitis virales suelen estar causadas por adenovirus, co!sac3ievirus, erpesvirus, rinovirus y virus influen&a o parainfluen&a.
4ari&.
#s el sitio típico de predominio de los estafilococos, fundamentalmente S. aureus y S. epidermidis. 5casionalmente podemos encontrar tambi"n Streptococcus pyogenes y S. pneumoniae, así como especies no patógenas de $eisseria, pero siempre tomando todas ellas como flora no residente sino ocasional o contaminante. #stos aspectos de residencia o no son particularmente importantes y difíciles de apreciar en la flora de la nari&. 0gualmente, la presencia de especies tipicamente fecales en niños no es infrecuente y debe tomarse como de contaminación.
#n niños prematuros pueden aparecer infecciones por E. coli , P. aeruginosa y C. albicans, generalmente como indicación de una infección m%s generali&ada. a o&ena, una infección que puede provocar la atrofia de la mucosa nasal, est% causada por 24s, como varias especies de lebsiella. 6. Tracto gastrointestinal. reas generalmente est"riles. #l esófago y el estómago est%n contaminados con bacterias que provienen de los alimentos, pero esa flora generalmente es eliminada rapidamente (e!cepción Helicobacter pylori que puede soportar el p7 del estómago). 0gualmente, el intestino delgado, ígado y vesícula biliar est%n est"riles o llevan poblaciones microbianas ocasionales y de forma transitoria. 0gual sucede con el peritoneo. +uando encontramos microorganismos en esas %reas suele deberse a efectos secundarios de enfermedades subyacentes (p.e. c%ncer) o por ruptura del intestino. a peritonitis puede estar causada por mucos microorganismos diferentes, todos ellos de origen fecal, y a ella cooperan generalmente bacterias aerobias y anaerobias, gram positivas y gram negativas. a peritonitis puede dar lugar a la aparición de abscesos intraabdominales (p"lvicos, retroabdominales, etc.). Todos ellos pueden mostrar una o varias especies de microorganismos, predominando las especies de Bacteroides, S. auresus, P. aeruginosa y E. coli . reas generalmente no est"riles. a parte del tracto gastrointestinal que invariablemente lleva microorganismos es el intestino grueso. a información e!istente acerca de la flora fecal normal es sorprendentemente pequeña, ya que generalmente los microbiólogos se an centrado en definir las especies patógenas, desdeñando casi sistematicamente otras especies aparentemente no patógenas. Por eemplo, la presencia de virus en la flora normal de individuos sanos no se a estudiado en detalle. $unque la variedad de bacterias es enorme, predominan las especies anaeróbicas. 0gualmente, el %rea geogr%fica del paciente, sus %bitos alimentarios y sanitarios, influyen decisivamente en el tipo de flora microbiana que puede aislarse. os microorganismos típicamente indígenas de esta parte del organismo son8 S. epidermidis y S. aureus, lactobacilos (particularmente en niños), Enterobacteriaceae, especies de los g"neros #la"obacterium, #usobacterium, Eubacterium, Propionibacterium, Bifidobacterium,
Bacteroides, etc. y P. aeruginosa. 0gualmente encontramos como flora normal gran variedad de proto&oos como Enatmoeba histolitica! 'richomonas hominis! etc., y de ongos filamentosos y levaduras.
as diarreas intestinales son una de las mayores causas de morbilidad en el mundo. $unque mucas de ellas est%n causadas por bacterias y par%sitos, en niños son particularmente una serie de virus como los de tipo 4or9al3, los adenovirus :ent"ricos: y en particular los rotavirus. $dicionalmente en niños pequeños (asta * años) son importantes los astrovirus y calicivirus. os agentes causales m%s comunes de las gastroenteritis son las salmonellas, sigellas, campilobacter y Helicobacter pylori . $dicionalmente, son importantes las especies de &ibrio (p.e. &ibrio choleare), algunas cepas de E. coli que e!presan ciertas to!inas (enteroto!ig"nicas) o con determinadas características (enteroaderentes, enteroagregativas, etc.). Tambi"n ay que tener en cuenta la posible infección ligada al consumo de alimentos, entre las cuales debemos citar las debidas a Bacillus cereus! Clostridium difficile! (eromonas hydrophila y estafilococos, que causan vómitos y-o diarreas debidas a la producción de varias to!inas. $dicionalmente, sobretodo en niños, debemos tener en cuenta las patologías debidas a proto&oos y elmintos, y )iardia. ;. Tracto genitourinario. reas generalmente est"riles. #stas %reas son por definición todo lo que no son los genitales e!ternos, la uretra anterior y la vagina. as enfermedades infecciosas de los riñones no est%n totalmente entendidas, pero se suponen dos vías de entrada de los microorganismos en los riñones8 sangre y ascendentes (de las vías urinarias). os m%s frecuentes agentes causales son 24s del tipo lbsiella*Enterobacter , P. aeruginosa! E. coli y especies de Proteus. $dem%s de ellos, podremos encontrar infecciones por mucos tipos diferentes de bacterias y virus reas no est"riles.
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2enitales e!ternos.
a flora indígena est% compuesta de S. epidermidis, varias Enterobacteriaceae, streptococos, enterococos, corinebacterias, Bacteroides! Pre"otella! #usobacterium! y C. albicans. 2eneralmente los genitales e!ternos est%n suetos a las mismas infecciones qe otras
%reas de la piel. Particularmente, aquí podremos encontrar lesiones de tipo ven"reo causadas por 'reponema (sífilis), $. gonorrhoeae (gonorrea), Haemophilus ducreyi (cancro), así como el linfogranuloma ven"reo causado por Chlamydia trachomatis.
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#st% coloni&ada por un n'mero apreciable de microorganismos en individuos sanos normales. #ntre ellos, los m%s frecuentes son8 estafilococos, enterococos, neiserias no patógenas, bacilos ent"ricos gramnegativos, clamideas, (cinetobacter baumanii! )ardnerella "aginalis! C. albicans. #n ocasiones puede aislarse 'richomonas "aginalis sin desarrollar enfermedad. as uretritis pueden estar causadas por mucos tipos de microorganismos, específicamente por en gonococo ( $. gonorrhoeae) o no especificamente por otros como estafilococos, clamideas, y bacilos gram negativos de la flora fecal. #n la mueres, la contaminación de la parte anterior de la uretra por la flora vaginal es casi universal.
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/agina.
a flora dominante son los lactobacilos (bacilos de =>derlein) tales como Lactobacillus acidophilus y especies relacionadas. $ pesar de esta predominancia, de la vagina de mueres normales sanas pueden aislarse otros microorganismos como8 S. aureus y S. epidermidis, b%sicamente los mencionados antes en la uretra anterior m%s Streptococcus agalactiae. ?uca de esa flora se supone que puede ser de origen o contaminación fecal. as enfermedades infecciosas m%s importantes de la vagina son las enfermedades de transmisión se!ual (#TSs)8 clamidiasis, gonorrea, sífilis ('reponema pallidum%, erpes (virus erpes simple! y papilomavirus), candidiasis, tricomoniasis, y las vaginosis causadas directamente por una gran variedad de microorganismos o por microorganismos que act'an como coloni&adores oportunistas en el marco de otra infección o durante su tratamiento. #ntre esos causantes secundarios de las vaginitis, los m%s frecuentes son )ardnerella "aginalis y varias especies de Mobiluncus! pero podemos encontrar todo tipo de microorganismos, en particular los típicos
abitantes de la flora fecal y de la piel. #ntre las mueres con abortos de repetición se a aislado Campylobacter fetus frecuentemente. @. Piel, eridas, y quemaduras. a piel supone la interfase entre el organismo y el medio ambiente, por lo que su flora microbiana est% muy influenciada por y reflea el medio ambiente concreto en el que se mueve el individuo. $ pesar de esta gran variabilidad, e!iste una flora típica de la piel, compuesta de especies de Staphylococcus! Corynebacterium! Propionibacterium! Mycobacterium! y varios ongos. as enfermedades infecciosas m%s normales de la piel est%n causadas por estafilococos, como S. aureus en granos, y S. epidermidis y Propionibacterium acnes en el acn". os microorganismos aislados de eridas reflean la flora del sitio donde se producen y la forma como se produce (p.e. traum%tica, quir'rgica, etc.), así como el grado de contaminación del %rea que se perforó en el proceso. as eridas producidas por traumatismo generalmente se complican con la flora aeróbica indígena de la piel, en particular S. aureus y S. epidermidis, Streptococcus de grupo $, P.aeruginosa! E. coli! Proteus! y (cinetobacter. #ntre la posible flora anaerobia asociada con eridas traum%ticas est%n varias especies de Clostridium, en particular C. perfringens y C. tetani , que, en condiciones adecuadas pueden producir gangrena gaseosa. a inmunidad frente al to!oide tet%nico delimita el riesgo. as infecciones postquir'rgicas podemos dividirlas en dos tipos. as primeras se originan a partir de una intervención limpia, es decir reali&ada en las meores condiciones de igiene posibles y sobre superficies corporales no fuertemente contaminadas. =e estas eridas suelen aislarse estafilococos, enterococos o bacilos gram negativos, y raramente otros como Streptococcus pyogenes, corinebacterias, pneumococos, clostridios o Bacillus subtilis. #l segundo grupo de infecciones provienen de intervenciones sobre %reas fuertemente contaminadas del organismo. #ste tipo de infecciones, adem%s del procedimiento quir'rgico, dependen en gran parte del estado de salud inicial del paciente, y est%n causadas por los microorganismos m%s abundantes del sitio concreto donde se reali&ó la intervención. os microorganismos m%s frecuentemente asociados con estas infecciones son8 E. coli! P. aeruginosa! lebsiella* Enterobacter*Serratia! (cinetobacter! Bacteroides! etc. as contaminaciones bacterianas de eridas graves se consideran unas afecciones muy comprometidas y su tratamiento puede e!tenderse durante años. $unque la flora m%s frecuentemente asociada es muy variada e incluye especies de enterococos,
estafilococos y bacilos gram negativos, el eemplo m%s frecuente y m%s difícil de erradicar es Pseudomonas aeruginosa. A. 5os y oídos. a flora m%s abundante reflea normalmente la de la piel. os microorganismos aislados m%s frecuentemente del oo son los estafilococos, y menos frecuentemente algunos estreptococos, neiserias y corinebacterias. =e las enfermedades infecciosas de los oos suelen aislarese S. aureus! P. aeruginosa! y especies de Haemophilus! particularmente H. influenzae y H. aegyptius. os microorganismos m%s aislados del oído son qui&%s Streptococcus pneumoniae y los bacilos gram negativos, incluida P. aeruginosa. #l oído medio e interno se consideran %reas generalmente est"riles, aunque en ocasiones puede coloni&arse a trav"s de la trompa de #ustaquio con flora nasofaríngea. os microorganismos que afectan a estas partes son generalmente Streptococcus pyogenes! S. pneumoniae! S. aureus y P. aeruginosa. B. Sangre, Sistema 4ervioso +entral y #!udados. a sangre y el líquido cefalorraquídeo (+C) deben considerarse como líquidos est"riles. 5casionalmente pueden aislarse en microorganismos en pequeño n'mero de sangre, como refleo de lesiones de la piel u otros sitios que an pasado inadvertidas. $unque eso en teoría puede complicar el diagnóstico desde el punto de vista microbiológico, esas situaciones son claramente diferentes del aislamiento en sagre de microorganismos que de forma transitoria o permanente se aislan en el curso, o como consecuencia de, infecciones primarias. os cultivos positivos a partir de sangre pueden deberse a mucos orígenes8 eridas quir'rgicas o traum%ticas, quemaduras, meningitis, pneumonia, obstrucciones biliares, intestinales, o urinarias, mucoviscidosis, etc. os tratamientos inmunosupresores, radiaciones, c%ncer, etc. pueden asimismo acompañarse por cultivos positivos. 4o puede indicarse una regla a seguir sobre qu" microorganismos se aislan m%s frecuentemente, dada la variedad de orígenes de los cultivos positivos, ni sobre la mayor o menor significación de encontrar uno u otro concreto. +iertamente, en los 'ltimos años, las especies de Staphylococcus aparecen muy frecuentemente y representan un procentae importante de los aislamientos en sangre. $ continuación podríamos incluir los bacilos gram negativos, comen&ando por E. coli y siguiendo por sus parientes lebsiella* Enterobacter , y tal ve& a continuación Enterococcus! y Candida. =esde el punto de vista de los virus, encontramos el /07 y los virus y + de la epatitis y los citomegalovirus. ?ucos de esos virus persisten en las c"lulas pero tambi"n en circulación, por lo que es importante el riesgo de transmisión.
os cultivos positivos a partir de +C tambi"n pueden reflear una gran variedad de condiciones. $dem%s de la meningitis, los traumas, complicaciones infecciosas de la cirugía, abscesos craneales y espinales, etc. pueden ser el origen de cultivos positivos. as causas de meningitis pueden ser muy variadas, y no sólo bacterianas, y dependen muco del tipo de paciente que se considere. #ntre las bacterias, e!isten infecciones sist"micas que pueden afectar a las meninges, incluyendo las salmonelosis, neumonías por pneumococos y por Haemophilus influenzae! tuberculosis, septicemias de reci"n nacidos por (cinetobacter , candidiasis generali&adas, y sepsis por practicamente cualquier bacilo gram negativo, particularmente E. coli y P. aeruginosa. a meningitis neonatal est% mas frecuentemente causada por Streptococcus agalactiae (estreptococos del grupo ), y en niños m%s mayores podemos aislar Haemophilus influenzae serotipo , Escherichia coli + y $eisseria meningitidis! mientras que en adultos predomina Streptococcus pneumoniae! $eisseria meningitidis! y el neumococo. as meningitis pueden ser causadas tambi"n por varios tipos de virus. $lgunos de ellos se recogen de meningitis :as"pticas: como enterovirus (co!sac3ievirus y ecovirus) y el virus de las paperas. 5tros est%n asociados a las verdaderas encefalitis, como el virus de la rabia, aunque se aislan menos frecuentemente. 1inalmente, como aislamientos que podemos encontrar est%n los ongos ( Cryptococcus neoformans% y los par%sitos como 'oxoplasma gondii.
