Honduras tiene 19 cuencas Hidrográficas, estás son:
1.- El Patuca El río Patuca es un río del noreste de Honduras, que se forma al sureste de Juticalpa por la confluencia de los ríos Guayape y Guayambre. Es el segundo río más grande de Centroamérica1 y el río más largo de Honduras, con casi 500 km de longitud y una cuenca de 23.900 km². El río fluye hacia el noreste por aproximadamente 10 millas antes de cruzar la costa de los mosquitos, y que desemboca en el mar Caribe en el punto de Patuca.
2.- El Chamelecón El río Chamelecón, es una vertiente fluvial que nace en las montañas del departamento de Copán, en el occidente de la r epública de Honduras o (macrocuenca Centro-occidente) y recorre unos 200 kilómetros hacía el norte, denominándose hidrográficamente como “Cuenca del río Chamelecón” que cruza el departamento de Santa Bárbara y seguidamente el departamento de Cortés, donde encuentra su punto más bajo el valle de Sula. A su paso se encuentra el río Humuya, río Jicatuyo y el río Sulces; y desembocando en las costas del mar Caribe.
3.- Rio Tinto o Negro Río Tinto o Negro. Nace en las cercanías de la ciudad Gualaco. Se encuentra situado en las aguas del Mar Caribe, en los tramos finales bordea la sierra del Río Tinto. Se encuentra a una altura de 1 metro sobre el nivel del mar. Cuenta con una longitud de 84.9667.
4.- Rio Humuya Río Humuya. Es una corriente hidrográfica del Departamento de Yoro en Honduras. Su nacimiento se encuentra en la cordillera de Montecillos, cerca del embalse sirviendo de linea de divisoria con el departamento de Cortés. y cruza la parte del medio del deparatamento Yoro. Longitud, 87.7333333 Altitud de la fuente, 5.0166667 Desembocadura, Golfo de Honduras
5.- Rio Platano La Reserva de la Biosfera de Río Plátano está localizada en los alrededores de río Plátano en La Mosquitia, la región en la costa caribeña de Honduras. Tiene una extensión de 5250 km² y abarca tanto montañas como tierras bajas de selva tropical con una gran biodiversidad. La reserva ha sido declarada Patrimonio de la Humanidad y Reserva de la Biosfera por la Unesco, en el año 1980.
6.- Rio Ribra Rio Ribra (Río Ribra) es un/una corriente (class H - Hidrográfica) en Departamento de Gracias a Dios (Gracias a Dios), Honduras (North America) con un código de región de Americas/Western Europe. Se encuentra a una altitud de 20 metros sobre el nivel del mar. Río Ribra se conoce también como Crique Ribra, Ribra Tingni, Rio Ribra, Río Ribra.
7.- Rio Ceales
8.- Rio Guayape Guayape es una municipalidad en el departamento de Olancho, en Honduras. Su nombre en mexicano significa "Agua Grande", fue llamado así por estar en el margen del río Guayape. El municipio colinda al norte con norte con los municipios de Yocón y El Rosario, al sur con el municipio de Guaimaca, al este con los municipios de Salamá y Concordia y al oeste con el municipio de Orica. Su cabecera está situada al pie del llamado Cerro Viejo y a la margen derecha del río Guayape. Este municipio está cruzado de Norte a Oeste por la montaña de La Loma y de Sur a Este por la de La Concepción.
9.- Rio Higuito El río Higuito es un importante río que atraviesa los departamentos occidentales de Copán, Lempira y Ocotepeque en la república de Honduras y es uno de los que abastecen al río Ulúa. El río Higuito drena alrededor de 1739 km².
10.- Rio Cangrejal La Cuenca del Rio Cangrejal es un sitio hermoso, rodeado de la exótica naturaleza del Parque Nacional Pico Bonito de la ciudad de La Ceiba. Esta ubicado a pocos kilómetros del centro de la ciudad, la entrada a la Cuenca esta a pocos metros de distancia del Puente Saopin, a mano derecha.
11.- Rio Choluteca El río Choluteca es un río de Honduras, en América Central. Posee una longitud de 210 km, sus nacientes se encuentran en las mesetas centrales y desemboca en el golfo de Fonseca, en el océano Pacífico. El río Choluteca nace en la montaña de hierba buena, municipio de Lepaterique, Departamento de Francisco Morazán, y sigue en dirección Este y Nordeste hasta pasar por Tegucigalpa donde se le reúnen el Guacerique y el Chimbo o Chiquito; desde aquí sigue rumbo al Norte, describiendo un semicírculo a Este y Sur, recorre las departamentos de El Paraíso y Choluteca y desemboca en el golfo de Fonseca, pasando antes por la cabecera del último de los departamentos nombrados y por el pueblo de Marcovia. Tiene una longitud de 250 km y cubre una cuenca de 7570 km².
12.- Pio Ulúa El río Ulúa es un río en la parte oeste de Honduras. Tiene su nacimiento en el área montañosa de Intibucá cerca de la ciudad de La Paz, y recorre 358 km hacia el noroeste en la dirección del golfo de Honduras.1 Sus principales afluentes son los ríos Humuya, Blanco, Otoro, y Jicatuyo. El río Ulúa es uno de los más grandes e importantes de Honduras, tiene su nacimiento en el departamento de Intibucá bajo el nombre de río Grande de Otoro que es conformado por la confluencia de los ríos Zarzagua y Puringla El Ulúa hace su recorrido de unos 400 km por los departamentos de Santa Bárbara, Cortés, Yoro y Atlántida donde es alimentado por los ríos Higuito, Mejocote, Lindo, Jicatuyo, Humuya o Comayagua y el Sulaco, además de muchos riachuelos. Por ser un río caudaloso el río Ulúa es también un río peligroso. Durante ciclones o lluvias torrenciales tiene una tendencia a crecer de forma desmedida, causando con ello daños a los poblados y ciudades por donde pasa. 13.- Rio Motagua El río Motagua es un importante río de la vertiente del mar Caribe de Centroamérica que discurre principalmente por Guatemala, aunque en su tramo final forma frontera con Honduras. Tiene una longitud de 486 km y drena una amplia cuenca de 12.670 km², que lo convierten en el río más largo y con mayor cuenca de Guatemala. El río nace en el altiplano occidental de Guatemala (14.949022, donde se le llama también río Grande, y corre al oriente hasta desembocar en el mar del Caribe cerca de Puerto Barrios. En sus últimos kilómetros el río marca la frontera entre Guatemala y Honduras. La cuenca del río Motagua tiene una superficie de 12.670 km² y es la cuenca más larga en Guatemala.
14.- Rio Cuyamel Se encuentra en el extremo occidental de la costa norte, muy cercana al río Motagua en la frontera con Guatemala. La longitud del río es de 20 kilómetros, nace en la montaña de San Idelfonso, perteneciente a la sierra de Omoa y Sesemboca en la Bahía del mismo nombre. Tiene un area de 93 km2 y una altura máxima de 850 msnm (metros sobre el nivel del mar), su pendiente media es de 4.25% y t iene una precipitación media de 2,492 mm/año. Por lo que se puede apreciar en el mapa, la Cuenca es de orden 2, pues tiene dos afluentes que se le unen, que son el rio Cuyamelito y el río Jimerito.
15.- Rio Lean Río Leán es un río que desemboca en la costa Caribe del nor te de Honduras, un poco al este de Tela en el Departamento de Atlántida. Longitud: -87.3333
16.- Lis Lis
17.- El Aguan El río Aguán es un río del norte de Honduras. Se origina en las tierras montañosas centrales del oeste, en el municipio de Yorito, Yoro, descendiendo por el noreste hasta las ciénagas costeñas, después de recorrer una larga distancia de 240 km y pasando sus aguas por los municipios de Arenal, Olanchito y Tocoa, para desembocar en Santa R osa de Aguán en el mar Caribe.
La cuenca del río Aguán mide 10 266 km². Los terrenos que se encuentran a lo largo del río son por lo general tierras fértiles, principalmente usadas para la agricultura, y ganadería, y actualmente también en la siembra de Palma Africana para la extracción de aceite de palma.
18.- Nacaome El río Nacaome es un río de la vertiente del Pacífico de Honduras,1 que nace de la confluencia de los ríos de la Sonta y Azacualpa. Tiene una longitud de 110 km1 si se incluye la extensión del confluente Azacualpa desde su nacimiento en la sierra de Letaperique al punto de confluencia en Los Encuentros hasta su desembocadura en el golfo de Fonseca (océano Pacífico). La cuenca del río Nacaome tiene una superficie de 3478 km ².
19.- El Sico. Río de Honduras con un recorrido aproximado de 215 km y que desemboca al noreste del país, en aguas del mar Caribe. Nace en las cercanías de la ciudad de Gualaco, y en sus últimos tramos bordea la sierra Río Tinto
