MAKALAH PRESENTASI MIKROBIOLOGI Keanekaragaman Domain Archaea
Disusun Oleh: Hasnil Hafid
BI/
Arini Novianti Wiwin Wirmasari
BI/ BI/7975
Fatmawati Sugiharja BI/8015 Indah Riwantrisna D. BI/8032
FAKULTAS BIOLOGI UNIVERSITAS GADJAH MADA YOGYAKARTA 2012
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT atas segala limpahan karunia dan rahmat-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan Makalah Mikrobiologi yang bertema Keanekaragaman Domain Archaea. Penyusunan makalah ini tidak lepas dari bantuan berbagai pihak. Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada : 1. Drs. Langkah Sembiring, M.Sc.,Ph.D, selaku Dosen Mata Kuliah Mikrobiologi yang telah membantu terselesaikannya makalah ini. 2. Ayah, ibu dan kakak yang selalu mendoakan dan memberi motivasi bagi penulis selama pelaksanaan penelitian dan penyusunan makalah ini. 3. serta teman teman yang tidak dapat penulis sebutkan satu persatu atas bantuan tenaga, pikiran, dan kerjasama selama penyusunan makalah ini. Penulis menyadari bahwa penelitian ini masih jauh dari sempurna dan masih terdapat banyak kekurangan. Oleh karena itu, kritik dan saran yang membangun sangat penulis harapkan. Semoga penelitian ini dapat bermanfaat dan menambah khasanah ilmu bagi kita semua. Amin.
Yogyakarta, 9 Maret 2012
Penulis
DAFTAR ISI
Cover i Halaman Judul
ii
Prakataiii Daftar Isi
iv
Daftar Tabel.................................................................................................................. Daftar Gambarv I. PENDAHULUAN A. Latar Belakang
1
B. Tujuan.................................................................................................................. II. KEANEKARAGAMAN DOMAIN ARCHAEA A. Domain Archaea B. Ciri-ciri
1
2
C. Penggolongan
2
D. Perbedaan dengan Domain Bakteria dan Eucarya 2 III. PENUTUP................................................................................................................
DAFTAR PUSTAKA 37
BAB I. PENDAHULUAN
A. Latar Belakang Definisi spesies merupakan tujuan dari sistematik. Sistematik diperlukan untuk mengenali kelompok organisme yang serupa dalam suatu skema hirarki. Dalam sistematik, keanekaragaman diatur dalam suatu tatanan melalui proses karakterisasi dan pengelompokan. Unit fundamental dari keanekaragaman adalah spesies, sehingga definisi yang tepat mengenai spesies penting untuk mempelajari keanekaragaman hayati di alam. Prokaryota menempati dua domain kehidupan, yaitu Bacteria dan Archaea. Kelompok mikroorganisme ini memiliki peran yang penting di alam dan sangat mudah tumbuh (versatile). Mereka berperan dalam berbagai siklus biogeokimia dan degradasi berbagai senyawa, baik senyawa alami maupun xenobiotik. Metabolisme yang dimiliki kelompok ini sangat beragam, seluruh jalur metabolisme yang dikenal pada makhluk hidup dapat ditemukan pada prokaryota. Mengingat pentingnya peranan prokaryota dalam menjaga stabilitas ekosistem, perlu dipahami keanekaragaman dan peranan komunitas mikroorganisme ini di alam. Walau mikroorganisme lebih berperan jika berada dalam suatu komunitas dibandingkan dengan jika berada sebagai individu yang berdiri sendiri (Buckley dan Schmidt, 2002), pengetahuan mengenai spesies-spesies yang menyusun struktur
komunitas penting untuk memahami keseluruhan sistem. Dalam makalah ini akan dibahas mengenai keanekaragaman Archaea.
B. Tujuan
BAB II. KEANEKARAGAMAN DOMAIN ARCHAEA
A. Sejarah Domain Archaea tidak diakui sebagai domain utama dari hidup sampai akhir-akhir ini. Sampai abad ke-20, ahli biologi menganggap semua makhluk hidup harus diklasifikasikan sebagai tanaman atau binatang. Tapi di tahun 1950-an dan 1960-an, ahli biologi akhirnya menyadari bahwa sistem ini gagal untuk mengakomodasi jamur, protista, dan bakteri. Pada tahun 1970-an, sistem Lima Kerajaan telah diterima sebagai sebuah model dari mana semua makhluk hidup dapat diklasifikasikan. Pada tingkat yang lebih mendasar, perbedaan dibuat antara prokariotik bakteri dan empat kerajaan eukariotik (tanaman, hewan, jamur, & protista). Perbedaan tersebut terdapat pada ciri umum sel eukariotik yaitu terdapat bagian yang berbeda nyata seperti nukleus, cytoskeletons, dan membran internal. Masyarakat ilmiah dikejutkan di akhir 1970-an oleh penemuan sebuah kelompok organisme yang sama sekali baru – Archaea. Archaea merupakan salah satu dari tiga domain di mana semua kehidupan yang diketahui dapat dibagi menjadi bacteria, eukariota, dan archaea. Eukaryota mencakup tanaman, hewan, jamur, dan protista. Bakteria pertama kali diamati pada abad ke-17 di bawah mikroskop oleh orang-orang seperti naturalis Belanda Antony van Leeuwenhoek. Ukuran kecil bakteri membuat mereka sulit untuk dipelajari. Klasifikasi awal bergantung pada bentuk individu, munculnya koloni di laboratorium, dan karakteristik fisik lainnya. Ketika biokimia berkembang sebagai ilmu pengetahuan modern, karakteristik kimia juga digunakan untuk mengklasifikasikan spesies bakteri, tapi bahkan informasi ini tidak cukup untuk terpercaya mengidentifikasi dan mengklasifikasikan mikroba kecil. Klasifikasi bakteri tidak dapat ditentikan sampai akhir abad 20 ketika biologi molekuler memungkinkan untuk menguraikan urutan DNA . Molekul DNA ditemukan pada sel-sel semua makhluk hidup, dan menyimpan informasi yang dibutuhkan sel untuk membangun protein dan komponen sel lain. Salah satu komponen yang paling penting dari sel adalah ribosom, dan kompleks molekul besar yang mengubah pesan DNA menjadi produk kimia. Sebagian besar komposisi kimia ribosom adalah RNA, molekul yang sangat mirip dengan DNA, dan yang memiliki urutan tersendiri. Dengan teknik pengurutan, ahli biologi molekuler dapat mengambil blok
bangunan RNA satu per satu secara terpisah dan mengidentifikasi masing-masing. Hasilnya adalah urutan dari blok bangunan tersebut. Karena ribosom sangat kritis penting adalah fungsi makhluk hidup, mereka tidak rentan terhadap evolusi. Sebuah perubahan besar dalam urutan ribosom dapat membuat ribosom tidak dapat memenuhi tugasnya membentuk protein baru untuk sel. Karena itu, kita dapat mengatakan bahwa urutan dalam ribosom adalah kekal – bahwa tidak banyak berubah dari waktu ke waktu. Evolusi secara molecular yang lambat ini membuat urutan ribosom menjadi salah satu kunci yang baik untuk mengetahui evolusi bacteria. Dengan membandingkan sedikit perbedaan dalam urutan ribosom antara keanekaragaman bakteri, kelompok urutan yang sama dapat ditemukan dan diakui sebagai grup terkait. Pada 1970-an, Carl Woese dan koleganya di University of Illinois di UrbanaChampaign mulai menyelidiki urutan bakteri dengan tujuan mengembangkan gambaran yang lebih baik tentang hubungan bakteri. Temuan mereka dipublikasikan pada tahun 1977, dan termasuk kejutan besar. Tidak semua mikroba kecil memiliki kaitan dengan lainnya. Selain bakteri dan kelompok eukariota, ada kelompok ketiga mikroba penghasil metana. Methanogen ini sudah terkenal akan keanehan kimiawi di dunia mikroba, karena mereka dimusnahkan oleh oksigen, menghasilkan enzim yang tidak biasa, dan memiliki dinding
sel
yang
berbeda
dari
semua
bakteri
yang
dikenal.
Inti dari pengamatan Woese adalah bahwa ia menunjukkan mikroba ini berbeda pada tingkat yang paling mendasar dari kondisi biologis mereka. Urutan RNA mereka tidak lebih seperti yang dimiliki bakteri dibandingkan ikan seperti atau bunga. Untuk mengenali perbedaan yang sangat besar, ia bernama kelompok “Archaebacteria” untuk membedakan mereka dari “Eubacteria” (bakteri sejati). Ketika pemisahan antara organisme ini menjadi jelas, Woese menyingkatkan nama aslinya dengan Archaea untuk menjaga orang dari pemikiran yang archaea itu hanya sebuah kelompok bakteri. Salah satu pendekatan yang digunakan dalam menangani pertanyaan adalah dengan melihat urutan gen duplikasi. Beberapa urutan DNA terjadi di lebih dari satu salinan dalam sel masing-masing, mungkin karena salinan tambahan dibuat di beberapa titik di masa lalu. Ada beberapa gen dengan jumlah sangat kecil yang diketahui ada dalam duplikasi dalam semua sel hidup, menunjukkan bahwa duplikasi terjadi sebelum pemisahan dari tiga
domain kehidupan. Dalam membandingkan dua set urutan, para ilmuwan telah menemukan bahwa Archaea sebenarnya mungkin lebih berhubungan erat dengan kita (dan eukariota lainnya) daripada bakteri. Secara tradisional, prokariotik dikelompokkan berdasarkan karakter fisiologi, komposisi molekuler, dan reaksinya terhadap pewarnaan gram, yang dibandingkan berdasarkan hubungannya secara evolusi. Berdasarkan perbandingan rangkaian RNA ribosomnya, para ahli membagi makhluk hidup prokariotik menjadi dua kingdom, yaitu kingdom Eubacteria dan kingdom Archaebacteria. Carl Woese (1970-an) dari Universitas Ulions (USA) menggunakan teknik biologi molekuler, yaitu analisis sekuen rRNA sub unit kecil untuk mempelajari kekerabatan semua makhluk, yaitu berdasarkan rRNA 16s atau 18s. Hasil yang diperoleh adalah anggota kelompok prokariot sangat berkerabat dengan dan sangat mirip satu sama lain. Berdasarkan hasil klasifikasi yang dibuat dengan mengacu pada analisis variasi molekul rRNA tahun 1978, Woese mengajukan pendapat bahwa sesungguhnya prokariot terdiri atas dua kelompok yang berbeda secara fundamental, yaitu Archaebacteria dan Eubacteria sehingga secara garis evolusioner kehidupan yang ditentukan berdasar analisis rRNA tersebut ada tiga, yaitu: Eubacteria, Archaebacteria, dan Eukariot. Kini Eubacteria disebut bacteria dan Archaebacteria disebut Archaea.
Gambar 1. Pembagian 3 domain kehidupan. (Madigan, et al., 2003)
Dr Carl Woese dan rekan-rekannya di University of Illinois sedang mempelajari hubungan antara prokariota menggunakan rangkaian DNA, dan menemukan bahwa ada dua kelompok yang jelas berbeda. “bakteri” yang hidup pada suhu tinggi atau yang terdapat metana terkumpul bersama sebagai sebuah kelompok jauh dari bakteri biasa dan eukariota. Karena perbedaan luas di genetik, Woese mengusulkan bahwa kehidupan dibagi menjadi tiga domain: Eukaryota, Eubacteria, dan Archaebacteria. Dia kemudian memutuskan bahwa istilah Archaebacteria keliru, dan menyingkatnya menjadi Archaea. Pada awal tahun 1970, Woese dan lain-lain mulai membandingkan sekuens asam nukleat untuk menemukan hubungan evolusi di antara mikroorganisme. Woese berfokus pada asam ribonukleat ribosomal (rRNA) karena ini adalah molekul yang sangat penting yang oleh karenanya tidak banyak berubah dari waktu ke waktu evolusi. Semakin sama urutan rRNA adalah antara dua mikroba, baru-baru ini mereka berbagi leluhur. Karena sekuensing asam nukleat belum ditemukan, Woese menggunakan metode tidak langsung untuk membandingkan urutan rRNA. Dia memotong molekul rRNA-potong dengan enzim, kemudian divisualisasikan potongan untuk ukuran menggunakan teknik yang disebut autoradiografi. Pola yang berbeda dari potongan rRNA ciri prokariota diketahui pada saat (bakteri), dan eukariota. Atas saran seorang rekan, Woese berkelana melampaui menyelidiki rRNA strain laboratorium umum bakteri dan dianalisis mikroba yang seorang mahasiswa pascasarjana telah dikumpulkan dari sistem septik dekatnya. Mikroorganisme ini adalah methanogen, mereka memproduksi metana (gas rawa) dari hidrogen dan karbon dioksida di lingkungan. Anehnya, pola rRNA untuk mikroba sistem septik tidak memiliki beberapa potongan yang telah diidentifikasi dalam lebih dari empat puluh jenis bakteri, dan memiliki beberapa tempat misterius sendiri. Woese menemukan metanogen lain yang tidak sesuai dengan pola prokariotik yang diharapkan atau fragmen rRNA. Pada tahun 1977, ia dan rekan-rekannya menerbitkan sebuah makalah penting yang dijelaskan sepuluh jenis methanogen bahwa "tampaknya hanya jauh dengan bakteri yang khas" (Woese 1977, hal. 5088). Meskipun publikasi selanjutnya terus membuat kasus untuk dua jenis prokariota, ide domain pada umumnya, dan dari archaea yang baru dibedakan khususnya, membutuhkan waktu lama untuk mendapatkan penerimaan. Kebingungan muncul atas penamaan awal "baru" organisme sebagai "archaebacteria." Bukan sebagai bakteri, melainkan archaea.
B. Deskripsi Archaea
Sejak tahun 1977, ahli mikrobiologi telah mengidentifikasi dan menggambarkan lebih banyak anggota beberapa domain Archaea. Sebuah ironi awal adalah bahwa mikroba ini hanya ditemukan dalam apa yang para ilmuwan sebut lingkungan yang ekstrim, seperti mata air panas dan laut dalam ventilasi hidrotermal. Penelitian lanjutan menunjukkan bahwa ini tidak terjadi. Archaea telah ditemukan di sawah, tanah, rawa, air tawar, dan di seluruh lautan. Sebagai ahli mikrobiologi lebih datang untuk menerima gagasan bahwa archaea tidak bakteri, perbedaan lebih muncul. Archaean RNA transfer (tRNA) molekul berbeda dalam urutan dari rekan-rekan mereka bakteri atau eukariotik. Dinding sel Archaean tidak memiliki peptidoglikan yang merupakan bagian dari dinding sel bakteri, namun membran sel Archaean termasuk molekul lipid tidak terlihat di jenis-jenis organisme. Archaea membuat metana menggunakan enzim yang berbeda daripada methanogen bakteri. Perbedaan paling mencolok antara kimia Archaea dan makhluk hidup lainnya terletak pada membran sel mereka. Mereka empat perbedaan mendasar antara membran archaea dan orang-orang dari semua sel-sel lain: (1) kiralitas gliserol, (2) ikatan eter, (3) rantai isoprenoid, dan (4) percabangan rantai samping. Ini mungkin terdengar seperti perbedaan kompleks, tetapi sedikit penjelasan akan membuat perbedaan tersebut dimengerti.
Kiralitas gliserol merupakan unit dasar dari membran sel yang dibangun adalah fosfolipid tersebut. Ini adalah molekul gliserol yang memiliki fosfat ditambahkan ke salah satu ujungnya, dan rantai samping dua terpasang pada ujung lainnya. Ketika membran sel diletakkan bersama-sama, molekul dari ujung gliserol dan fosfat keluar di permukaan membran, dengan rantai samping panjang terjepit di tengah. Lapisan ini menciptakan penghalang kimia yang efektif di sekitar sel dan membantu menjaga keseimbangan kimia. Gliserol membuat fosfolipid archaea adalah stereoisomer dari gliserol yang digunakan untuk membangun membran bakteri dan eukariotik. Dua molekul yang stereoisomer adalah cerminan satu sama lain. Sementara bakteri dan eukariota memiliki D-gliserol di membran mereka, archaea memiliki L-gliserol. Komponen kimia sel harus dibangun oleh enzim, dan “kidal” (kiralitas) dari molekul ditentukan oleh bentuk enzim tersebut. Sebuah sel yang membangun salah satu bentuk tidak akan mampu membangun bentuk lain.
Ketika rantai samping ditambahkan ke gliserol, sebagian organisme terikat bersama-sama menggunakan ikatan ester. Rantai yang ditambahkan memiliki dua atom oksigen pada salah satu ujung. Salah satu dari atom-atom oksigen digunakan untuk membentuk link dengan gliserol, dan yang lainnya menjorok ke sisi lain ketika ikatan dilakukan. Sebaliknya, rantai archaea terikat menggunakan keterkaitan eter, yang kekurangan atom oksigen tambahan. Hal ini berarti fosfolipid yang dihasilkan memiliki sifat mekanik kimia yang berbeda dari lipid membran organisme lain. Rantai lain dalam fosfolipid bakteri dan eukariota adalah asam lemak, rantai dari biasanya 16 sampai 18 atom karbon. Archaea tidak menggunakan asam lemak untuk membangun fosfolipid membran mereka. Sebaliknya, mereka memiliki sisi rantai 20 atom karbon dibangun dari isoprena. Isoprena adalah anggota paling sederhana dari kelas bahan kimia yang disebut terpene. Menurut definisi, terpene adalah molekul yang menghubungkan molekul isoprena bersama-sama.. Setiap unit isoprena memiliki “kepala” dan “ekor” akhir, tetapi tidak seperti rekan-rekan mereka, blok isoprena dapat bergabung dalam banyak cara. Sebuah kepala dapat disambungkan ke ekor atau ke ujung kepala, dan ekor bisa juga bergabung. Berbagai senyawa terpene yang dapat dibangun dari unit isoprena sederhana termasuk beta-karoten (vitamin a), alam dan karet sintetis, minyak esensial tumbuhan (seperti spearmint), dan hormon steroid (seperti estrogen dan testosteron).
Tidak hanya rantai samping dari membran achaea yang dibangun dari komponen yang berbeda, tetapi rantai itu sendiri juga memiliki struktur fisik yang berbeda. Karena isoprena digunakan untuk membangun rantai, ada sisi cabang diluar dari rantai utama. Asam lemak dari bakteri dan eukariota tidak memiliki cabang-cabang samping ini. Sebagai contoh, rantai samping isoprena bisa bergabung bersama-sama. Ini dapat berarti bahwa dua rantai samping dari fosfolipid tunggal dapat bergabung bersama-sama, atau mereka dapat
bergabung ke rantai fosfolipid sisi lain di sisi lain membran. Tidak ada kelompok lain dari organisme dapat membentuk fosfolipid transmembran tersebut. Sifat lain yang menarik dari cabang-cabang samping adalah kemampuannya untuk membentuk cincin karbon. Hal ini terjadi ketika salah satu cabang mengelilingi dan mengikat atom bawah rantai untuk membuat cincin lima atom karbon. Cincin tersebut diperkirakan memberikan stabilitas struktural membran, sehingga dapat membuatnya bertahan di lingkungan bersuhu tinggi. Archaeans sensitif terhadap obat antibiotik yang berbeda dari bakteri, menunjukkan perbedaan mendasar dalam struktur sel. Namun, archaea juga berbagi karakteristik dengan anggota dua domain lainnya. Mereka memiliki beberapa molekul permukaan yang sama sebagai bakteri dan ion transportasi dalam banyak cara yang sama. Tapi archaea memiliki protein yang terkait dengan DNA mereka yang menyerupai protein histon dari eukariota dan mensintesis protein dengan cara yang mirip dengan eukariota. Juga seperti eukariota, genom Archaean memiliki gen lebih terganggu dengan urutan intron, dan urutan lebih diulang, daripada genom bakteri.
C. Pembagian Filum pada Archaea
Berdasarkan karakteristik yang ditemukan Archaea terbagi ke dalam 4 filum yaitu Crenarchaeota, Euryarchaeota, Korarchaeota dan Nanoarchaeota.
1. Crenarchaeota Berikut ini adalah klasifikasi Archaea anggota filum Crenarchaeota Class : Thermoprotei Order : Thermoproteales Family : Thermoproteaceae Genus : Thermoproteus Genus : Caldivirga Genus : Pyrobarculum Genus : Thermocladium Genus : Vulcanisaeta Family : Thermofilaceae Genus : Thermofilum Order : Caldisphareales Family : Caldisphaeraceae Genus : Caldisphaera Order : Desulfuroccales Family : Desulfuroccaceae
Genus Desulfurococcus Genus Acidilobus Genus Aeropyrum Genus Ignicoccus Genus Ignisphaera Genus Staphylothermus Genus Stetteria Genus Sulfophobococcus Genus Thermodiscus Genus Thermosphaera Family : Pyrodictiaceae Genus Pyrodictium Genus Hyperthermus Genus Pyrolobus Order : Sulfolobales Family : Sulfolobaceae Genus Sulfolobus Genus Acidianus Filum ini kebanyakan terdiri dari organisme yang dikenal sebagai organisme termofilik. Beberapa organisme dari filum ini tumbuh pada temperature di atas titik didih air. Kebanyakan mengandalkan metabolism sulfur sebagai sumber energy atau akseptor elektron. Sebagai contoh, beberapa oksidasi reduksi senyawa sulfur secara aerobic untuk
menghasilkan asam sulfat. Lainnya mereduksi elemen sulfur dan menggunakannya sebagai akseptor wlwktron untuk membentuk hydrogen sulfide. Beberapa organism mereduksi besi dan mangan. Tidak semua Crenarchaeota bersifat termofilik. Crenarchaeota juga ditemukan di lingkungan dasar lautan seperti di laut kutub. Banyak archaea memiliki temperature optimal lebih dari 80 0C, dan Pirolobus, merupakan ekstrim termofil yang berhasil diisolasi, memiliki temperature optimal 1060C. Archaea seperti Pirolobus yang dapat tumbuh pada suhu 900C atau di atasnya juga disebut hipertermofi. Yang menarik, Archaea ekstrim termofil jumlahnya menjadi melimpah hanya di atas temperature yang membuat bakteri termofilik menjadi sedikit jumlahnya. Archaea tersebut ,memiliki temperature optimal di bawah 800 C, baik itu yang metanogenik, ekstrim halofil atau termofilik moderat dan asidofilik. Jadi, archaea memiliki relung (niche) yang membuat bakteri jarang atau tidak terdapat di dalamnya. Lebih jelasnya, Archaea hanya melimpah pada habitat yang tidak memungkinkan bakteri untuk tumbuh seperti pada temperature tinggi atau berkadar garam tinggi atau jika mereka tidak memperoleh energy yang dibutuhkan seperti pada metanogenesis. Archaea ekstrim termofili terbagi menjadi aerob obligat dan fakultatif dan anaerob obligat. Aerob biasanya bersifat asidofil dan memiliki pH optimum sampai 2,0. Obligat anaerob kebanyakan neutrofilik dan memiliki pH optimum lebih dari 5,0. Kendatipun kondisi ekstrim selalu ditemukan organism ini, adaptasi terhadap lingkungannya adalah sama kompleksnya dengan yang ditemukan pada kondisi mesofil. Contohnya, hipertermofil Pyrodictium abyssi membentuk suatu bola putih tipis dalam air kaldu panas pada temperature 970 C yang disusun dari kompleks jaringan tubul tiga dimensi. Meskipun alasan secara fisiologis untuk struktur ini tidak diketahui, sel dengan jelas menyediakan diri dengan proporsi yang besar dari sumber dayanya untuk membuatnya.
2. Euryarchaeota Berikut ini adalah klasifikasi singkat anggota filum Euryarchaeota Class : Methanobacteria
Order : Methanobacteriales Family : Methanobacteriaceae Genus : Methanobacterium Genus : Methanobrevibacter Genus : Methanosphaera Genus : Methanothermobacter Family : Methanothermaceae Genus : Methanothermus Class : Methanococci Order : Methanococcales Family : Methanococcaceae Genus : Methanococcus Genus : Methanothermococcus Family : Methanocaldococcaceae Genus : Methanocaldococcus Class : Methanomicrobia Order : Methanomicrobiales Family : Methanomicrobiaceae Genus : Methanomicrobium Genus : Methanoculleus Genus : Methanofollis Genus : Methanogenium
Genus : Methanolacinia Genus : Methanoplanus Family : Methanocorpusculaceae Genus : Methanocorpusculum Family : Methanospirillaceae Genus : Methanospirillum Genera incertae sedis Genus : Methanocalculus Order : Methanosarcinales Family : Methanosarcinaceae Genus : Methanosarcina Genus : Methanococcoides Genus : Methanohalobium Genus : Methanohalophilus Genus : Methanolobus Genus : Methanomethylovorans Genus : Methanimicrococcus Genus : Methanosalsum Family : Methanosaetaceae Genus : Methanosaeta Class : Halobacteria
Order : Halobacteriales Family : Halobacteriaceae Genus : Halobacterium Genus : Haloarcula Genus : Halobaculum Genus : Halobiforma Genus : Halococcus Genus : Haloferax Genus : Halogeometricum Genus : Halomicrobium Genus : Halorhabdus Genus : Halorubrum Genus : Halosimplex Genus : Haloterrigena Genus : Natrialba Genus : Natrinema Genus : Natronobacterium Genus : Natronococcus Genus : Natronomonas Genus : Natronorubrum Class : Thermoplasmata
Order : Thermoplasmatales Family : Thermoplasmataceae Genus : Thermoplasma Family : Picrophilaceae Genus : Picrophilus Family : Ferroplasmataceae Genus : Ferroplasma Class :Thermococci Order : Thermococcales Family : Thermococcaceae Genus : Thermococcus Genus : Palaeococcus Genus : Pyrococcus Class : Archaeoglobi Order : Archaeoglobales Family : Archaeoglobaceae Genus : Archaeoglobus Genus : Ferroglobus Genus : Geoglobus Class : Methanopyri Order : Methanopyrales
Family : Methanopyraceae Genus : Methanopyrus
Organisme Euryarchaeota sebagian besar terdiri dari halophiles ekstrim dan methanogen. Organisme halofilik ekstrim hidup di habitat asin. Mereka membutuhkan lingkungan asin untuk bertahan hidup. Kita dapat menemukan organisme tersebut di danau berkadar garam atau daerah di mana air laut terevaporasi (menguap). Methanogen membutuhkan oksigen bebas (anaerobik) kondisi untuk bertahan hidup. Mereka menghasilkan gas metana sebagai produk sampingan dari metabolisme. Anda akan menemukan organisme ini dalam lingkungan seperti rawa-rawa, lahan basah, keberanian binatang (sapi, rusa, manusia), dan dalam limbah. Contoh Euryarchaeota meliputi: -
Halobacterium - termasuk beberapa spesies organisme halofilik yang ditemukan di danau berkadar garam dan lingkungan laut berkadar garam tinggi.
-
Methanococcus - Methanococcus jannaschii adalah organisme Archaea hasil sequencing genetik pertama. Metanogen ini tinggal di dekat ventilasi hidrotermal.
3. Korarchaeota Organisme Korarchaeota dianggap bentuk kehidupan yang sangat primitif (kelompok Archaea tertua) dibanding kelompok Archaea yang lain. Anggota kelompok ini ditemukan di lingkungan sumber mata air panas di dasar samudra dan daratan. Sampai saat ini belum ada strain yang dapat diisolasi dalam kultur murni, sehingga sedikit yang diketahui dari sifat-sifat fenotiknya.
Gambar 4. Nanoarchaeota Pada tahun 2005 dikenal sebagai organisme terkecil.(400 nm). Organisme Nanoarchaeota merupakan organisme anaerobic, ekstrim termofilik, dan sifatnya mampu bersimbiosis dengan Archaea lain. Merupakan Archaea yang anggotanya hanya memiliki satu genus yaitu Nanoarchaeum. Organisme ini Merupakan parasit yang hidup melekat pada sel Ignicoccus (Solomon et al., 2008). .
I.
PENUTUP
Archaeota merupakan
DAFTAR PUSTAKA
Brooker, R.J., E.P. Widmaier, L.E. Graham, & P.D. Stiling. 2011. Biology 2nd Edition. McGraw-Hill. New York. p: 547. Delong.,E.F.2003.Ocean of archaea: abundant oceanic crenarchaeota appear to derive from
thermophilic
ancestors
that
invaded
low-temperature
marine
environments.ASM (American Society for Microbiology News.P Vol 59 (10) : 503510. Dworkin, M., S. Falkow, E. Rosenber, K. Schleifer, & E. Stackebrandt. 2006. The Prokaryotes. Springer. New York. pages: 14, 29, 61, 71, 84, 106, 116, 182, & 242.
Forterre,P.,C.Brochier,and H.Philippe.2002.Evolution the archaea.Theoretical population biology. Vol 61.Elsevisier Science.USA.pp.409-422. Huber,H.2011. Investigations on the novel purely archaeal biocoenosis Ignicoccus hospitalis
and
Nanoarchaeum
equitans.
http://www.biologie.uni-
regensburg.de/Mikrobio/Thomm/Arbeitsgruppen/huber_en.htm (Diakses tanggal 17 Desember 2011). Karner, M. B., E. F. DeLong. 2001. Archaeal dominance in the mesopelagic zone of the Pacific Ocean. Nature 409 (6819): 507–510. Setiawan,
A.
2011.
Tiga
Domain
Kehidupan.
http://id.shvoong.com/exact-
sciences/biology/2231520-tiga-domain-kehidupan/#ixzz1gZiQNn00
(Diakses
tanggal 14 Desember 2011). Solomon, E.P., L.R. Berg, & D.W. Martin. 2008. Biology 8th Edition. Thomson Brooks/Cole. Belmont. pp: 519-521. Stewart,R. 2010. Microbial Food Webs. http://oceanworld.tamu.edu/resources/environment-book/microbialwebE.html (Diakses tanggal 15 Desember 2011). Trivedi, P.C., S. Pandey, & S. Bhadauria. 2010. Text Book of Microbiology. Aavishkar Publisher. Jaipur. pp: 252-253. Zillig.
1989.
In
Bergey’s
Manual
of
Systematic
Bacteriology,
J.T. Staley et al. eds., Williams & Wilkins pub., p. 2241.
Vol.
3,
